Basic Information

Symbol
SP7
RNA class
mRNA
Alias
Sp7 Transcription Factor OSX Osterix Zinc Finger Protein Osterix Transcription Factor Sp7 OI11 OI12
Location (GRCh38)
12:53326575-53345315
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001173467.3
Sequence length
3123.0 nt
GC content
0.5572

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1199.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1251.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 781.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001173467.3 NCBI
AGUAGCAGAAGCAGCAGCCGCCGAGCAGCAGCAAGGACUCUGGAGUCAG… 3123 nt 0.5572
NM_001300837.2 NCBI
GAGGCACGGGAUGGAGGCGAGAUCCCCGGCGGCCCUGAGCCUGGCCUAG… 3190 nt 0.5621
NM_152860.2 NCBI
AACUUUAGAUCUCUUCUCUCCCAUUCUCCCAUUCUCCCUCCCUCUCCCU… 2997 nt 0.5512
Summary

This gene encodes a member of the Sp subfamily of Sp/XKLF transcription factors. Sp family proteins are sequence-specific DNA-binding proteins characterized by an amino-terminal trans-activation domain and three carboxy-terminal zinc finger motifs. This protein is a bone specific transcription factor and is required for osteoblast differentiation and bone formation.[provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.