Basic Information

Symbol
SP8
RNA class
mRNA
Alias
Sp8 Transcription Factor Transcription Factor Sp8 Specificity Protein 8 BTD
Location (GRCh38)
7:20782279-20786886
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182700.6
Sequence length
3626.0 nt
GC content
0.5510

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1429.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1496.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 823.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_182700.6 NCBI
AUUGUAUUGCACACCUCUAAAAAAAACACUGCCUCUGAUUUAUCAAUAU… 3626 nt 0.5510
NM_198956.4 NCBI
AUUGUAUUGCACACCUCUAAAAAAAACACUGCCUCUGAUUUAUCAAUAU… 3722 nt 0.5543
Summary

The protein encoded by this gene is an SP family transcription factor that in mouse has been shown to be essential for proper limb development. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2011]

Forensic Context

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