Basic Information

Symbol
SPATA25
RNA class
mRNA
Alias
Spermatogenesis Associated 25 TSG23 DJ337O18.8 C20orf165 Spermatogenesis-Associated Protein 25 Testis-Specific Gene 23 Protein Chromosome 20 Open Reading Frame 165
Location (GRCh38)
20:45886491-45887622
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_080608.4
Sequence length
742.0 nt
GC content
0.6159

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-330.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -343.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 145.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_080608.4 NCBI
AUUCCCUCACAAACCGGGGCUUUGGGGAAGCCAUGUCCUACUUCAGGAC… 742 nt 0.6159
Summary

Involved in spermatogenesis. Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that burn injury in aged animals triggers a distinct transcriptomic profile in inguinal white adipose tissue, where the SPATA25 was significantly upregulated alongside genes linked to inflammation and tissue repair [Punit Bhattachan et al. DOI:10.1096/fj.202501420R].