Basic Information

Symbol
SPATC1
RNA class
mRNA
Alias
Spermatogenesis And Centriole Associated 1 SPATA15 SPERIOLIN Spermatogenesis And Centriole-Associated Protein 1 Spermatogenic Cell-Specific Cdc20-Binding Protein Spermatogenesis-Associated Protein 15 MGC61633 Testicular Tissue Protein Li 181 Speriolin SPRN
Location (GRCh38)
8:144012280-144047114
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_198572.3
Sequence length
2170.0 nt
GC content
0.6442

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-884.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -921.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 515.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001134374.2 NCBI
ACAUUCCAGGCCGAGGCAAGGCCUGUGUACAGGCCUGGUGGCAUGGAGA… 2030 nt 0.6478
NM_198572.3 NCBI
ACAUUCCAGGCCGAGGCAAGGCCUGUGUACAGGCCUGGUGGCAUGGAGA… 2170 nt 0.6442
Summary

Predicted to enable gamma-tubulin binding activity. Located in centrosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans integrating Summary data-based Mendelian randomization with single-cell RNA sequencing identified the SPATC1 as one of 17 genes whose expression levels are pleiotropically associated with sepsis [Yang et al. DOI:10.1111/jcmm.18559].