Basic Information
Symbol
SPON2
RNA class
mRNA
Alias
Spondin 2
DIL1
Mindin
Differentially Expressed In Cancerous And Non-Cancerous Lung Cells 1
Spondin 2, Extracellular Matrix Protein
M-Spondin
Spondin-2
DIL-1
Location (GRCh38)
4:1166932-1208962
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_012445.4
Sequence length
1579.0 nt
GC content
0.6536
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-695.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-721.49 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
285.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGCCACUUCCAGCAUGUAGACUGAAGUCAGGCCACGCACAGGGCUCUCC… | 1776 nt | 0.6503 | |
| GUGUUUGUGAACUGGCGAUGUGAUCGAGGGCACGGGUGCUGGGCUUCCC… | 2043 nt | 0.6417 | |
| ACCCGACCGCUGCCGGCCGCGCUCCCGCUGCUCCUGCCGGGUGAUGGAA… | 1579 nt | 0.6536 |
Summary
Predicted to enable antigen binding activity; lipopolysaccharide binding activity; and metal ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within several processes, including defense response to other organism; opsonization; and positive regulation of cytokine production. Located in extracellular exosome. Biomarker of meningioma. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]
Forensic Context
A study in human menstrual blood-derived stem cells (MenSCs) identified the SPON2 as a differentially-expressed gene that was down-regulated with increasing passage number [Chen et al. DOI:PMC4713568]. Separately, a multi-omics study in human sepsis patients identified the SPON2 as a potential biomarker significantly associated with 28-day mortality via Mendelian randomization analysis from a low-risk, downregulated gene list [Li et al. DOI:10.1038/s41598-025-99619-z].