Basic Information

Symbol
BBX
RNA class
mRNA
Alias
BBX High Mobility Group Box Domain Containing HBP2 HSPC339 MDS001 HMG Box Transcription Factor BBX HMG Box-Containing Protein 2 BBX, HMG-Box Containing Bobby Sox Homolog X 001 Protein Bobby Sox Homolog (Drosophila) Ag Recognized By Treg Cells 1 ARTC1
Location (GRCh38)
3:107522936-107811339
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001142568.3
Sequence length
9009.0 nt
GC content
0.3922

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2392.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2561.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2403.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142568.3 NCBI
GUUGCAUGUACUGUAUGUGGAGCAGUGUACAGUGAAGCGGAGGCAGAGC… 9009 nt 0.3922
NM_001276286.2 NCBI
GUUGCAUGUACUGUAUGUGGAGCAGUGUACAGUGAAGCGGAGGCAGAGC… 8000 nt 0.3907
NM_020235.7 NCBI
GUUGCAUGUACUGUAUGUGGAGCAGUGUACAGUGAAGCGGAGGCAGAGC… 8919 nt 0.3923
Summary

Enables sequence-specific double-stranded DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to act upstream of or within bone development. Predicted to be located in chromatin. Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.