Basic Information

Symbol
BCAP31
RNA class
mRNA
Alias
B Cell Receptor Associated Protein 31 DXS1357E BAP31 6C6-Ag CDM B-Cell Receptor-Associated Protein 31 6C6-AG Tumor-Associated Antigen BCR-Associated Protein Bap31 BCR-Associated Protein 31 MICRODELXq28 Protein CDM P28 Bap31 DELXQ28 Bap31 DDCH P28
Location (GRCh38)
X:153698006-153725957
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001256447.2
Sequence length
1284.0 nt
GC content
0.5452

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-467.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -490.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 420.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001139441.1 NCBI
GAAGCCCCACCUGGAGGAGCGGCCGGGAUGGGCCUCCGGGACGGUGUGC… 1346 nt 0.5587
NM_001139457.2 NCBI
GAUGGGCCUCCGGGACGGUGUGCCAGGCCGGGGCCAAGUCGGAGGCCCC… 1828 nt 0.5881
NM_001256447.2 NCBI
GUGGGAGAGUUCUGUUGCUGCGGCGGGGCCUGCACGUUGACUGUGGGAA… 1284 nt 0.5452
NM_005745.8 NCBI
GUGGGAGAGUUCUGUUGCUGCGGCGGGGCCUGCACGUUGACUGUGGGAA… 1417 nt 0.5695
Summary

This gene encodes a member of the B-cell receptor associated protein 31 superfamily. The encoded protein is a multi-pass transmembrane protein of the endoplasmic reticulum that is involved in the anterograde transport of membrane proteins from the endoplasmic reticulum to the Golgi and in caspase 8-mediated apoptosis. Microdeletions in this gene are associated with contiguous ABCD1/DXS1375E deletion syndrome (CADDS), a neonatal disorder. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. Two related pseudogenes have been identified on chromosome 16. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.