Basic Information

Symbol
SQLE
RNA class
mRNA
Alias
Squalene Epoxidase Squalene Monooxygenase SE EC 1.14.14.17 ERG1
Location (GRCh38)
8:124998467-125022287
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003129.4
Sequence length
2962.0 nt
GC content
0.4652

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-917.88 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -977.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 822.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003129.4 NCBI
GAGACGCGUGGAGCCUGGCGGCGAGUGGGGGCGUGCGACGGUUACUCUG… 2962 nt 0.4652
Summary

Enables FAD binding activity and squalene monooxygenase activity. Involved in lipid droplet formation; regulation of cell population proliferation; and sterol biosynthetic process. Located in intracellular membrane-bounded organelle and membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the SQLE, a gene involved in cholesterol metabolism, exhibited chronically decreased expression following contusive spinal cord injury [Aimone et al. DOI:10.1016/j.expneurol.2004.05.042].