Basic Information

Symbol
SSC4D
RNA class
mRNA
Alias
Scavenger Receptor Cysteine Rich Family Member With 4 Domains S4D-SRCRB SRCRB-S4D SRCRB4D Scavenger Receptor Cysteine Rich Domain Containing, Group B (4 Domains) Scavenger Receptor Cysteine-Rich Domain-Containing Group B Protein Four Scavenger Receptor Cysteine-Rich Domains-Containing Protein Scavenger Receptor Cysteine-Rich Protein SRCRB-S4D Scavenger Receptor Cysteine Rich Family, 4 Domains
Location (GRCh38)
7:76389017-76409744
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_080744.2
Sequence length
2800.0 nt
GC content
0.6304

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1273.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1317.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 813.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_080744.2 NCBI
CUUUUUCUGGGGCCGCUCCAGCUGGUGCCGGCCACCUCCACUCCCCUUU… 2800 nt 0.6304
Summary

The scavenger receptor cysteine-rich (SRCR) superfamily is an ancient and highly conserved group of cell surface and/or secreted proteins, some of which are involved in the development of the immune system and the regulation of both innate and adaptive immune responses. Group B SRCR domains usually contain 8 regularly spaced cysteines that give rise to a well-defined intradomain disulfide-bond pattern.[supplied by OMIM, Apr 2004]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.