Basic Information

Symbol
SSR2
RNA class
mRNA
Alias
Signal Sequence Receptor Subunit 2 TRAPB TLAP Signal Sequence Receptor, Beta (Translocon-Associated Protein Beta) Translocon-Associated Protein Subunit Beta Signal Sequence Receptor Subunit Beta Translocon-Associated Protein Beta SSR-Beta TRAP-BETA TRAP-Beta HSD25
Location (GRCh38)
1:156009041-156020968
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003145.4
Sequence length
1108.0 nt
GC content
0.5208

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-365.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -388.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 321.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003145.4 NCBI
CUUUCGGAUGCUGACGCUCUCUUCCUGUCUUUGUGGCUCCGGAAAGGCG… 1108 nt 0.5208
Summary

The signal sequence receptor (SSR) is a glycosylated endoplasmic reticulum (ER) membrane receptor associated with protein translocation across the ER membrane. The SSR consists of 2 subunits, a 34-kD glycoprotein (alpha-SSR or SSR1) and a 22-kD glycoprotein (beta-SSR or SSR2). The human beta-signal sequence receptor gene (SSR2) maps to chromosome bands 1q21-q23. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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