Basic Information

Symbol
STRC
RNA class
mRNA
Alias
Stereocilin DFNB16
Location (GRCh38)
15:43599563-43618800
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_153700.2
Sequence length
5515.0 nt
GC content
0.5893

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2310.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2402.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1719.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_153700.2 NCBI
GCCCUGCCCUCACCUGGCUAUCCCACACAGGUGAGAAUAACCAGAACUC… 5515 nt 0.5893
Summary

This gene encodes a protein that is associated with the hair bundle of the sensory hair cells in the inner ear. The hair bundle is composed of stiff microvilli called stereocilia and is involved with mechanoreception of sound waves. This gene is part of a tandem duplication on chromosome 15; the second copy is a pseudogene. Mutations in this gene cause autosomal recessive non-syndromic deafness. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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