Basic Information

Symbol
BCL2L1
RNA class
mRNA
Alias
BCL2 Like 1 BCL2L BCLX PPP1R52 Bcl-X Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 52 Apoptosis Regulator Bcl-X Bcl-2-Like Protein 1 Bcl-XL Bcl-XS BCL-XL/S Bcl2-L-1
Location (GRCh38)
20:31664452-31723989
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138578.3
Sequence length
2574.0 nt
GC content
0.5660

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1005.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1051.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 545.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001191.4 NCBI
CUCGAUCCGGGCGAUGGAGGAGGAAGCAAGCGAGGGGGCUGGUUCCUGA… 2385 nt 0.5665
NM_001317919.2 NCBI
CUCGAUCCGGGCGAUGGAGGAGGAAGCAAGCGAGGGGGCUGGUUCCUGA… 2556 nt 0.5665
NM_001317920.2 NCBI
GCCGCGGCACCGGAAGUGACUGAGCUUGCAAGUUCCCCUGUCUCUUCAG… 2405 nt 0.5630
NM_001317921.2 NCBI
GCCGCGGCACCGGAAGUGACUGAGCUUGCAAGUUCCCCUGUCUCUUCAG… 2534 nt 0.5722
NM_001322239.2 NCBI
GCCGCGGCACCGGAAGUGACUGAGCUUGCAAGUUCCCCUGUCUCUUCAG… 2423 nt 0.5625
NM_001322240.2 NCBI
GCCGCGGCACCGGAAGUGACUGAGCUUGCAAGUUCCCCUGUCUCUUCAG… 2552 nt 0.5717
NM_001322242.2 NCBI
ACUGGUGCUUUCGAUUUGACUUAAGUGAAGUAUCUUGGAACCUAGACCC… 2389 nt 0.5555
NM_001424331.1 NCBI
ACUGGUGCUUUCGAUUUGACUUAAGUGAAGUAUCUUGGAACCUAGACCC… 2362 nt 0.5567
NM_001424332.1 NCBI
ACUGGUGCUUUCGAUUUGACUUAAGUGAAGUAUCUUGGAACCUAGACCC… 2380 nt 0.5563
NM_138578.3 NCBI
CUCGAUCCGGGCGAUGGAGGAGGAAGCAAGCGAGGGGGCUGGUUCCUGA… 2574 nt 0.5660
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the BCL-2 protein family. BCL-2 family members form hetero- or homodimers and act as anti- or pro-apoptotic regulators that are involved in a wide variety of cellular activities. The proteins encoded by this gene are located at the outer mitochondrial membrane, and have been shown to regulate outer mitochondrial membrane channel (VDAC) opening. VDAC regulates mitochondrial membrane potential, and thus controls the production of reactive oxygen species and release of cytochrome C by mitochondria, both of which are the potent inducers of cell apoptosis. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding two different isoforms. The longer isoform acts as an apoptotic inhibitor and the shorter isoform acts as an apoptotic activator. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

A study in human prostate tissues demonstrated that the BCL2L1 was significantly upregulated in a time-dependent manner, showing considerable increases at higher postmortem intervals (96 h and 120 h) compared to a 24-hour control, which supports its role in time-of-death estimation [Tolbert et al. DOI:10.1016/j.gene.2018.06.090]. Research in mice further showed that the BCL2L1 expression was rapidly elevated in heart tissue after a single high-dose chlorpromazine administration and maintained for one week of repeated high-dose treatment, indicating a distinct anti-apoptotic response to drug exposure [Tsai et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2011.04.006].