Basic Information

Symbol
SYT16
RNA class
mRNA
Alias
Synaptotagmin 16 CHR14SYT Strep14 SYT14L Synaptotagmin XIV-Related Protein Synaptotagmin 14-Like Protein Chr14 Synaptotagmin Synaptotagmin XVI Synaptotagmin-16 Yt14r Synaptotagmin XIV-Related Synaptotagmin XIV-Like Chr14Syt STREP14 Syt14r SYT14R
Location (GRCh38)
14:61811849-62112550
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001367656.1
Sequence length
14213.0 nt
GC content
0.3797

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3738.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4022.6 kcal/mol
Frequency: 5.49e-201
Diversity: 4179.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001367650.1 NCBI
GGCCCACUUGGAGCCUACGGAGAUGGCGUUGAGCGGUUUCGCAGGAGAG… 13615 nt 0.3776
NM_001367652.1 NCBI
GAGCGCACCGGGCCUGCCGAGGAGCGCGCGCCCGGCCGGGCUCGGCGCC… 13546 nt 0.3775
NM_001367654.1 NCBI
GAGCGCACCGGGCCUGCCGAGGAGCGCGCGCCCGGCCGGGCUCGGCGCC… 13333 nt 0.3757
NM_001367656.1 NCBI
GAGCGCACCGGGCCUGCCGAGGAGCGCGCGCCCGGCCGGGCUCGGCGCC… 14213 nt 0.3797
NM_001367657.1 NCBI
GAGCGCACCGGGCCUGCCGAGGAGCGCGCGCCCGGCCGGGCUCGGCGCC… 13506 nt 0.3758
NM_001367659.1 NCBI
GAGCGCACCGGGCCUGCCGAGGAGCGCGCGCCCGGCCGGGCUCGGCGCC… 13719 nt 0.3775
NM_001367661.1 NCBI
GAGCGCACCGGGCCUGCCGAGGAGCGCGCGCCCGGCCGGGCUCGGCGCC… 14386 nt 0.3797
NM_001367663.1 NCBI
GGUGAGUCUCACACUCAAGUAAGCAGCUGGCUUUCCUUUACCCCUGCUA… 14382 nt 0.3778
NM_001387087.1 NCBI
GAGCGCACCGGGCCUGCCGAGGAGCGCGCGCCCGGCCGGGCUCGGCGCC… 14136 nt 0.3799
NM_001387088.1 NCBI
GAGCGCACCGGGCCUGCCGAGGAGCGCGCGCCCGGCCGGGCUCGGCGCC… 14044 nt 0.3787
Summary

Predicted to enable phospholipid binding activity. Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that Syt16 was one of 32 genes commonly dysregulated over time and due to burn injury, showing upregulation with larger fold changes in the burn group compared to sham controls [Wu et al. DOI:10.007/s10753-019-00984-5]. This gene has been previously reported in the literature as associated with wound healing.