Basic Information

Symbol
TACR3
RNA class
mRNA
Alias
Tachykinin Receptor 3 TAC3R NK3R NKR Neuromedin-K Receptor Neurokinin B Receptor Neurokinin Beta Receptor NK-3 Receptor NK3 Receptor NK-3R TAC3RL HH11 NK3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_001059.3
Sequence length
5359.0 nt
GC content
0.3736

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1284.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1395.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1423.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((((((((((....)))))))(((((((((((...)))))....(((........)))..)))))).((((....(((((((..(((((((((.(((((((((((((....(((((((((..((......))..))))))))).((((.......)))).....(((.((((((.((((((((((((.....))))))..(((((....))).)).)))))).))).))))))))))))).....)).))))))))(((((.((((...(((((((((.((((.((((((...((((((....)))))).(((((((.((........(((.....(((((.(((((.(.((((((((.((((.....((((.(((((((((.....).))))))))...))))..((((....)))))))).))))...((((((......))))))))))).))))).)))))))))))))))))....)))))).....)))).))))))))))))))))))...........(((((..((((..(((.....)))....))))..)))))..)))))(((((((((((((((((((((((((((.((((((..(((((((((....(((.(((...))).)))...))).))))))....)).))))..........(((.....(((..........(((.....))).))).....)))((((((.........((((.((((....)))).)))).........)))))).)))))))))(((.((((((.............((((.......)))).......((((((..((((((((((((((..(((((.((((((((...((((...(((((....(((((.(((((..(((..((((........))))......((((((((..(((........))).((((((..(((.((((...........)))).)))(((.((((((......(((.....)))))))))....))).............((((((((.(((((((.((((((((((((((((.((((.(((((((.((..((((((....(((((((..(.(((((((......(((((.((((.......)))).))))).....((((.(((((..((((((((((...(((....(((.((..(((((...(((((((....))))))))))))....)).))))))))))))....))))...))))).....))))....((((((..........))))))(((......)))..((((....))))(((((((...)))))))..(((((((...............(((((.(...((((.((((((....((........))...))).))).))))....).)))))....(((((((.((((...)))).)))))))...)))))))(((((....)))))........))))))).)..)))))))..))))))..))))))).(((...))).((((....))))......)).))))))))))...(((((((.(((......((((((..((((.(((((....)))))..)))))))))).((((...........))))...(((((......(((((((..(((.......((((((.(.((((((((.......))).))))).).)))))).......)))))))))).....))))))).).)).)))))((.(((((..((((((((...(((.((((.......(((......)))..........)))))))...)))).)))).))))).))....)))))...)))))...((..((((((...))))))..))..((((........)))).((((((...(((((((((...((((.((..((((((((((............((((((.(((.(((.((((((..........................)))))))))...))).)))))).....)).))))))))..))...)))).))))))))).))))))..))))))).))))))))))))))(((.....)))........(((((....(((((......)))))...)))))...((((((((..((((....))))..))))))))...(((((((((..........((((((((((........((((((((((((.(.((((....)))).).))..))))))))))...((((((((((((((((.((.(........)))...)))))))))..)))))))...............((((((((.((((((.......)).)))).))))))))..............)))))))))))))))))))......)))).)))))))....))))).))))).......((((((.((((((.......)).))))))))))..)))))..)))).....))))))))........((((((((((((..............(((((((((..((.......))..))))))))).....................((((((((((((.....))))).........(((....)))......(((((....)))))....(((((((((((........))).))))).))).....(((((((.((((((((((((((((...((.................))...)))))))..(((((((........)))))))......((...))..(((((((.((.....)).))))))).....((((((.....)))))).))))))))).)))))))...((((((...........))))))..)))))))..........(((((((((..(((((((.........(((((.....((((.((.........((.....(((((....))))).....))........)).))))))))).(((((((......(((......)))))).)))).....(((((......)))))...))))))).....)))))))))(((.(((((..(((...(((((((....))))))).......)))..))))))))...................)).)))))))))))))))))))))).................(((((.....)))))..............)))))))...))))))..(((((((.......((((........))))........)))))))...............)))))))))..........(((((((....(((((((((((((((...((((.....................(((((...............(((((....)))))......((((((.........))))))..(((((((((.(((.......(((.....)))((((((.....))))))..(((((......)))))........))).))))).))))((((((((.((((((......)))))).)))).))))...(((((.((((((((.((((((.((((....))))..)))))))))))...))).)))))......)))))(((((((....(((((..........)))))))))))).............(((((.....((((((....)))))).....)))))))))....)))))))))........))))))...)))))))....................))))))))))...))))))))...................(((((((.........(((((((((((((...((((((.(((........))).))))))..)))))).....((((.((....((((((((((((((((((..((((.((.(((((....))))))).)))).)))).......(((((((((((.((((((((.......)))))))))).)))))....)))).......(((....(((((((....((((.(..(((....(((((((..((.(((((.((((...(((..((..((((((.................((((((((((................))))))))))(((((........)))))...........((((((((((((......((..((.((.(((..(((((.....))))).))).)).))..))......((((..((((((.....((((((((..................((((.....((((((((...)))).))))(((.((((((....)))))).)))..)))).....))))))))((((.....))))(((((..((.........((((((((......((((...((((((......))))))....))))..((((((((((((....))))))).....)))))......................................(((((((........)))))))...))))))))))..)))))....((((((((..((((.(((((....))))..(((......)))..).))))..)))))))).))))))..))))...)).))))))))))((((.((.........)).))))......(((......))).))))))..))..)))....)))).))))).)))))))))....)).)..)))))........)))))))....)))....)))))))........((((((((...))))))))..(((.(((....((((.......))))....)))...))))))))))....)).)))).......((((((....))))))......................(((.((((.(...((((((....))))))...).))))..))).......)))))))..(((......)))....(((((((.(((....((((((...)))))))))...)))))))(((........)))(((.(((......))).))).((((....))))...))))))).)))))))..)))).............)))))).........((((((((((((((((....(((((((....)))))))..(((((((((((((((...........)))))))(.(((((.....))))).).....((((..(((.(((.(((((((((....))))))))).))))))..))))(((((......)))))))))))))...................)))))).)))))))))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{,((,,,((((((((((....))))))}{{{(((,{,({{{{{{{{....,,,,.........,,..)))|}}((((((((((((((({{({((((((.((....)).))))).,...(((((((((..((......))..))))))))).,,||.....}}))),{{((..((((.((((((((...((((({.{{{..(((((..((((((((((((....(((((((((({,{,,{|||.,,||||||}}.,,,.{(|.,(((((.((((...(((((((((.((((.(((({(...((((((....)))))).{((((((.{(,{....}}|||.....(((((.(((((.(.(({(((((.((((.,,..((((.(((((((((.....),}))))))).,,)))),,((((,,..,|},}}}).))))},,|(((({......)))))).)),).))))).))))))),}}))))))}..{,|}}})),...,)))).))))))))))))))))))...))},....(((((..((((,.(((,...,))),,..))))..)))))...(((((.(((((((((((((((.((((...({(((((((..{{(,...((((..{(((..,,.(((((.((({{((.((((((((..((........}}.))))))))....,(((.......,..|||....,|||{{,,........||||||||.......((((.((((....)))).)))).....,{{{|,||,,...})})},....||,.................))))))...))))).,,....))))))))((((((((((..((.((((..(((((((.....((((...{{{....,{,(((.(((({,....}}.....}))).))).,|||{,{{,,{{(((....,(((,.......}},........})}).}}....))))},..}}}.)))).....)))))))..).)))))...)))))))))).)},,,))))))))..))))))))},)))))))))))))))......(((((((.(((..(((((........)))))....))))))))))..,{(((((((..(((((.((((.......)))).))))}..((((((,,{(((,(,((({{(((({,..{(({....,...|}}{((((...{{{|{{{....))))))))))}),}}}|,.|||,|||||||}{{{.|{||,,..(((((((((({((.,..{(((((..........))))))(((......)))..((((....))))(((((((...)))))))..,{.,..,.....{(((((...........((((((({((({,,....}},,,||{{(((((({{...{{{|||{,,..,,{||||..|||||{{{{,||,..,})))).})}||||{....))))},{{{{.,,.|||||.....,,}}))),..))))))))))))}..)))}..,)))))))))..}}|}..((.(((((((........,...))))))).}}.,))},}}))})).,},..,(((((..((((.(((((....)))))..)))))))))))))))))))))))}.)))))))))..)))))...(((((((..{((.,..,,.((((((.(.((((({{{.......}})}}))}}.}.)))))).......)))))))))).....)))))))))))).)}}..({.(((((..((((((((...(((.((((.......{((......}}}..,.......)))))))...)))).)))).))))).)){{((((.....,,,.......})))}}.......{{{.((((...((((........)))).{(((((...(((((((((...((((.{(..(((((((({{.{..........{(((((.(((.,,{.((((({.......,|,.........,......})))}},,}...))).))))))....,)).))))))))..))...)))).))))))))).)))))},,{...,{{|,,.(((((.(((,...,{(((((((..(((({.(((((....(((((......)))))...))))}...((((((((..((((....))))..))))))))...(((((((((..........((((((((((........((((((((((((.(.(((,....}))).}.)}..))))))))))...((((((((((((((((.,,.(........))}...)))))))))..))))))).,,..,,....,,..((((((((,(({,((.......)}.)))).,)))))))..............)))))))))))))))))))...,{{{.....,,,{{{....}}}.(((......)))..,{((((.(((({(,......,}.)))),)))))})))..))))))))).,...,.,,|.,,||,,......}}...((......)).......,((((((((..((.......))..)))))))))))).)))))...,,}}......,..,,.(((((.....)))))..))))}}}(((....)))......(((((....)))))..})))))....)))))))}.})))))}).,,.,,.,|...(((((((.(((((((({(((((((...((...,,.......,,...))...)))))))..(((((((.,....,.)))))))......{{...}}..(((((((.((.....)).))))))).....((((((.....)))))).})))))))).)))))))...},.....)))))))}}}))))))....{||||,{|,..||}}|||||{{,{{.{{(((((.{,,,{,.,(((({.,,{((({,.{{....,,,,.....,..,(((({{{..,,,,.}}}}))}......{||,,,,,}})))...,,||,,,|||{{{{||....})))}|,||||....,|{{((,,,,,,}}}}}...}}}}}))}|,,||||||||||{{{,,....,,|||...(((((((....)))))))(((((((((((((((({....,{({..........{{,{{((......})))}}..........,))))...}}})))))))))))))))...(((((........)))))..{{{,....{{(((,,((({(((.......{{{{........|}||.,,,,,,,|}}}}}|,|||,{{||||,.....{,{{((((......,.((((.{(({....}}}}..}|||{,,{{{{||||},{{,,.,.......,...}|||,{,...............(((({....})))).,,,}}||||||...,,,,.,,}}|||,,{{{,{((((.(((.,,....,{,....,||.((((((.....)))))).}||{{{.,....}}}}|........}}),))})).,)))}})}}|||,||{{{,,,,,..|||,,|,||.,.}}}}..,|||||,|(((((({{((((((.((({....))))..)))))))))))}},.,,.,},})}}},.,))})),,}},.....{{{{{{{{{....((((({,(((((.((((((.(((((,{({({((((,{{((((({....}))))}...|,.,,,||}.}}))))}}},((((....,,{(((((.({(.(,.......})).)))),,)}}...))))...|}},,.,})}))))).)))))))))))))))))..,{{,,...}}}}}}|||||||||{(|||,}},||||||.{{(,,,,,.,,|}}.}}))}}..||||||{...}}))))}|}}},,}}}}}}||,|||||}}}},{{|{,{{{(({,,..,.)))))||{{{.,.))))}.......,,,{((((({.{(({{{....,,.{{||||||||||,.{{{{{{.,{|.......,,|((....(((((((....{{{(.(,..{{....{||||,,..,,,((((({.(((((((((((....,||,,||,.{{{{,.........((((((((((................))))))))))|||||.,,,,,.,}}}},...,,,,,.,.{{{{||||||,,.......,..{{,((.{{{,,{{{{,.....}}}}}.,},.||,|||,}.....}}||,,.|||}|||||||,.|||||||....,.,,..{{{......{{{{{{{{{{{{{{{{...}))}}}}},{{{.{(((((....)))))).)))...||||...,.((({{.,(({{.....}))),|{{({{{{{{{{{....,,||||,,.|||,,|||,...{{{{{{......})))))|||{||,}....,,.(((((((....)))))))....,}}}}}....,,,,.......................||,....|||||||,...{{{{.||||,,...||||||||{.{{{.((((.((((((((((..((((.(((((....}))}..{({,.....}}},.}.))))..)))))),..,,,,|||{||,,..,))}})),}},,,|((((............))))).|,.....,,|.}}}}}))).))).))))))))}}}}}}}).,,.))))).,.)))))))}}}})).}..,,)))....,...)))))))....))}.....}))))}......|,{(((((((...))))))))}..,,.,,|}....,,,..,,.,,}})},,,,,,,..}}}})),}}}.{{{....}}}|.,,,,{.((((((....)))))).,....,,,.......,,|...(((.((((.{...((((({....))))))...}.))))..))}.......}}})})}}}}))..,,,,}))},..{((((((.(((....((((({...}))))))))...))))))}{{{....,,.,)))}|}}}}|....,..,,,}))}|{{{....}}}}|}}}}}}|,..,}}}},,,.}}}}}}..,||||.,..})))).,,..,}},.(((((((((({{(((({{{{,((((,,..,}))}))))},||,{{{{{{{{{{|{{{{{{.,,{||}|}||,{{{{{|{{,,|{{{,....,,,.},||{,..({{{(((.(((((((({....})))))))).))))))..}}||(((((......)))))}))))))}.,....,,,,,,,,,,,..,))))),,))))))))).............

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUUCUCCAGCCUGUGCCGGGCAGCUGGCACCCUCCCUACGUGUGAUGU… 5359 nt 0.3736
Summary

This gene belongs to a family of genes that function as receptors for tachykinins. Receptor affinities are specified by variations in the 5'-end of the sequence. The receptors belonging to this family are characterized by interactions with G proteins and 7 hydrophobic transmembrane regions. This gene encodes the receptor for the tachykinin neurokinin 3, also referred to as neurokinin B. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the TACR3 is an orthologous gene associated with inflammatory processes in radiation-induced lung injury [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].