Basic Information

Symbol
TAOK3
RNA class
mRNA
Alias
TAO Kinase 3 MAP3K18 JIK DPK Cutaneous T-Cell Lymphoma-Associated Antigen HD-CL-09 Dendritic Cell-Derived Protein Kinase Thousand And One Amino Acid Protein 3 Serine/Threonine-Protein Kinase TAO3 CTCL-Associated Antigen HD-CL-09 Kinase From Chicken Homolog A Jun Kinase-Inhibitory Kinase JNK/SAPK-Inhibitory Kinase EC 2.7.11.1 HKFC-A STE20-Like Kinase EC 2.7.11 KDS
Location (GRCh38)
12:118149801-118372920
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016281.4
Sequence length
4346.0 nt
GC content
0.4429

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1200.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1286.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1125.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001346497.2 NCBI
AGAACUGUGUACGAUCAUGACUGGAAAGCAGGAUCCCUCAGUGACUGCC… 2041 nt 0.4454
NM_016281.4 NCBI
AGGAGCCGCACCUCGGACAGCAGCAGCGGCGGCGGCCGCGGGAGGGUCC… 4346 nt 0.4429
Showing 11 to 12 of 12 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a serine/threonine protein kinase that activates the p38/MAPK14 stress-activated MAPK cascade but inhibits the basal activity of the MAPK8/JNK cascade. The encoded protein is a member of the GCK subfamily of STE20-like kinases. [provided by RefSeq, Oct 2016]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in post-mortem human blood samples identified two groups of up- and down-regulated genes, with pathway analysis indicating active processes promoting cell survival and DNA damage repair shortly after death [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].