Basic Information

Symbol
TBC1D17
RNA class
mRNA
Alias
TBC1 Domain Family Member 17 FLJ12168 TBC1 Domain Family, Member 17
Location (GRCh38)
19:49877501-49888751
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024682.3
Sequence length
2095.0 nt
GC content
0.6286

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-864.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -899.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 804.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001168222.2 NCBI
AGUGGGGCCUUCGGCGGCGACUAUGGAAGGAGCCGGCUACAGGGACAAU… 1996 nt 0.6328
NM_024682.3 NCBI
AGUGGGGCCUUCGGCGGCGACUAUGGAAGGAGCCGGCUACAGGGUGGUG… 2095 nt 0.6286
Summary

Predicted to enable GTPase activator activity. Involved in retrograde transport, endosome to Golgi. Located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the TBC1D17 in microglia, where it is involved in the mitophagy pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].