Basic Information

Symbol
TBC1D22A
RNA class
mRNA
Alias
TBC1 Domain Family Member 22A C22orf4 Chromosome 22 Open Reading Frame 4 TBC1 Domain Family, Member 22A Putative GTPase Activator HSC79E021
Location (GRCh38)
22:46762617-47175699
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014346.5
Sequence length
3758.0 nt
GC content
0.5934

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1532.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1598.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1206.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((.((((((((...)))))).)).))))))..(((((((((((((((((........((((((....((((((((((((.((((((((.(((......))).)))))((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((.....)))))).(((...((....))..)))...(((((.(((.((.....)).))).)))))....))))....(((((((.((......((((.(((((((..(((...((((......)))).....)))))))))))))))).)))))))..((((((.((.((((.((.(((..........))))).)))).)).))))))............)))))))))))))((((..(((((((...(((.(((.(((((((.((..((((..((.(((((((.((.......)))))).))).))..))))(((((((.(((..(((((.(((((((....))))))).)))))((((....(((((............)))))..))))..(((((.((((((((((..((((.(((...((.((((.(((((.((((((((..((((.(((..((((((((.....(((((((((.((((((....((((.((....((((.((((((((..(((((.(((((.(((((....(((((....)))))....)))))((.((((((((((......((((((((......((.((.....(((((((....((((....((((((((((..((.(((.(..(.(((((.(((((.(((((....)))))(((((..(((...)))....))))).(((...((((.((((.((((((((((((((..((((((.(((((......)))))((((.(((..((....((((((((((..((((......))))..((((.(.(((.((((.(..((......))..).))).).))).).))))....((((.(((((..(((((..((((..((((((((....))))))))..)))).))))).....((((.(((((.(((......(((((..((((...((((...))))((((((((((((((...((((....))))..))))))))..))))))((((.((((.((((....)))).)))).))))(((((((.((.((.........)))).))))).)).)))).)))))..)))))))).))))...)))))))))..........((((...)))).((((........)))).........)))).))))))))..))).))))((((.(((((((((((..((((.........(((((((..((.((((.(((...(((...)))....))).))))......((.(((((((((.(((..........)))..).))).))))).)).(((((...)))))))....)))))))))))..))).)).))))))))))))))))..))))(((((((((......)).(((((......))))).(((((....))))))))))))...((((((..(((((....((((((.(((((...(((((.(((.(.(((..(((((.....)))))..(((.((....)).)))(((.....(((..........))).....)))))).).))))))))))))).))))))((((((......))))))....)))))..)))))).....))).))))))))))).)))).....)))........(((((((((((((((...))))..)))).....)))))))....))))).))))).)..)...))).))..))))))))))..(((..........)))(((((.((((....)))).))))).((((((((((((.(((((((((........)))......(((((((((...(((.....((((((((((.(((.((((.((((.(((((((..((((..((((......))))..))))))))))).)).)).)))).))).)))))))))))))(((.(((.........))).))).....(((.(((((....))))).))).......(.((((.....)))).)....)))))))))))))))....))))))).)))))((((...)))).((((.(((......))).))))..))))....))))))).....)).))))))))))......)).)))))))).)).....))))).)))..))..)))...))))).))))....)).))))))))))....))))))))))))))))).))).))))....))...))))))..........((((((....))))))...(((..(((((...)))))...)))....(((((...))))))))))))))))..))))))).((((.(((((((((((((((.(..((((....))))..).))))).(((((..((((((((((((((((((((..((((..(((.(((.....))).))).........(((((((((((((.......)))...(((....))).(((((.....)))))..)))))).))))..))))..)))))..))))))((((.((((..((((((((....(((((((((((((.((.....))))))))....))))))))))).))))..))))))))))))))))).(((((((((..(((((((((((((..(((.(((((((((((((....).))))))))..)))).))).)))))))).(((((((((((((((.......))))))))))...)))))(((......))))))))...))).)))))))))))((..(((((...)))))..)).......)))))))))).)))))))))))))))))))....)))))))))).......)).)))))))))))))...((((((((((....))).....)))))))...((((....)))).))))))).)))).((((..(((....)))..)))).........)))))))).)))))))))..))).))).)))))))))..)))))).((......))......((.(((((((..(((((...((((.((((((....((((.((((........................((((((((...............)))))))).........((.((.((((..((......))..))))...)).))....)))).)))))))))).))))...)))))...))))))))))))).))))....)))))))))....(((..((((.(.(((....((((((((...(((((((((((((((((((.((.((......((.((.....((((((...(((((((.....)).)).)))...))))))....)).))..)))))))))))))....((((((((...(((.(((((((..........((((((((((.((((........))))))))).)))))...(((((.(((((....)))))....)))))((((((......))))))...((((((...((.....))....)))))))))))))))).....))))))))....)))))))))).....)))))).)).....))).).)))).))).....(((.((.......)).))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{.((((({..,.|}|}}}{((((,(({({.{{(((((,((((.{((((((((((((((((.,(,...((((((((..(((.(((((((((.((,({,.((((..((((.{({{({{..(((.(((((((.((((((.(((((((((((((((({(((......(((((((((.({(((,...{{..(((,..(((((.(((.((.....)).))).))))),},......(((((.,((((,{.{{{{.((((.(((((((..(((...((((......)))),,,..,,,))))))))))).{.(((((({..{{(((({((.((((.{(.((,......,,,.}}))).)))),))})}}}}).....,{{{.||||||||{|,((({{(,((,{.,......}}|{(((((((,...{{((((((,,..||,{{.((((.{....}.))))},((((.(((((((((.,,({((((((((.(((((.(((((((....))))))).)))))((((,...(((((............)))))..)))){((((,,...}}}))|.,.({(,..,.},}.,.,}}}}}}}}|||}...,}),,,}}}..)))))))))))))...))}},,.)))))).)))).))))|||,||}}},.}}}})),))).,,,)))))))},((.(((((....(((((....)))))....)))))))...(((((((,{(.(((((.((((((((((({{((({{....,,(((,(((({{{{......(((((.((.((((((({((....,,...||...,(((((....}}}|}(((((..(((...)))....))))),},,...|,,..))}}|||))))))).}))))........,,,,,......,,}||(,{......{{{|{{.....,.{(((.(((((......)))).}.}))),.......(({{{{((......|,....,}}|..,}}.(((((({{{(((.,.,,...,.(((((..((((..((((((({....})))))))..)))).))))).{{{{((..........))))))))))))))))).....,}}}}).))).((((((((((((((...((((....))))..)))))))}..))))))((((.((((.((({....)))).)))).)))).}})))}))))),....},),))))).{(((....))))...))))}}))))))|...((((...(((.........))).))}},,..{{||.{((({........))},.,).))}}..))))).)))))))))...((.(((({{(((((((((((..((((.........(((((((..{(.((((.(((.,.(((...))).,..))).))))......{(,(((((((((.(((.,{...,,..)))..).))).))))).)).(((((...)))))))....)))))))))))..))).)).))))))))))).))..)))},))}))|)}})).....,,.(((((......))))).,}|))))}))),)),,,)))))))}}))|||.{,|....,})||.(((((....))))).)))))))))))))).))))..)).)))))...)).)))..})),.)),.))))..)))).,..)}..)).)))).))))).)))..))).))))),.})))))))))))))..((((((((.((...)).)))))..)))}))},,,,||}},|||}|||||.},...,|||}|,(((|{(((((((..{{{{{{(((({|{,,(({({{(,.((({|{{.,...((((.(((((((......(((((((((.,((({.(((((((..{....}..))))))).)))|{(((((({{((({,(((((({((((((({((..(((((........)))}...}}}||{((({{...(((,....{(((((((((.(((.((((.((((.(((((((..((((..((((......))))..))))))))))).)).)).)))).))).))))))))))))),{,.,||......,,,))}.,}}.....,((.(((((....}}}}).})),,.....{.((({.....}))).,..,,))}))))))))))))}}}})))))}|.||}|}((((...)))}.((((,((,......,||||}||||||{.{||||||{.{{(,{(((({(((({(({((({...,{{{|||,|||,,|{{.|.||||||...}}.|))),|,}}}}||((((|.((((((({(((((((((..,.((((.((((((..(((((((((...))).)).))))..)))))))))),...((((({....}))))).....)))))....(((((({(..(((((....)))))((((((....)).))))..))))))))((((.{{{{||||.||||..}}}}}}|{.}}}))))}})}))))))}}})}.,}})||))))},}}}))))))))).....))))))).})))},)})))},}}}||||(((((((((({((,{,.,{{||||,{((({,{{|||.(((((.....))))}.,,}})))}))|)|||||,,{(((|((({({{.|((({{((({..{((((((({,{,.,,,{((|||||||{{...,,)))))))},|,.,,,,)))))))}}))),.)))))}}}}|}}}||||||{|{|{,({{.({,{,((((((((..(((.(((((((((((({....,.)))))))}..}))).))}.)))))))).||,{,|||{||||,|,,||,|.|||||||||||..}||||{{{..,..,||,}}||},,.|}|||||}||{,(((({{{{{{{{|||,)))).,.|{|||||}},}}})))))},|||||,,}}},)})))|{|||||},,||}|,||},},})))}}||..))}},)))}}}}))),})))))))}})}}}}),}}})))}..,,,|}))))),)}||,}))}},,}|}}{{{{.,(((....}}},.}}}},,}}}}}).}}}}}}},{({{{{.{||,..,.((.(((((((.......,....))))))).))..}.,.))).)|||||{..{,((({..,{{{|{{((((({..,|({|{(((..,.....,..)))))}}...}}}}}}(((((.{{..,,.(((({......))))).....}}..}}||}{(({..((......))..)))|{.{{{.{{.|,,,,,)})))))),}))))))),,,}}},|{{{||||,|||,,..,.)))}...}|||,,,...})))||{|}||||,|,{|{.,,.{(((((((...(((((((((((((((((({{((.((.{,.,.,(.((.,...((((((.,,({(((((.....)).)).)))...))))))..,.)).))}}),))))))))))).,,.((((((((...(((.{((((((....||||||{(((((((((.((((........))))))))).)))),...{{{{{.{((((....))))),,..))}}}((((((......})))))...,{{(((...((.....}}....))))))))))))}))),....))))))))....)))))))))).,...)))))).)),..,.))}.),)))}.}}}....})))}}},...,,.,,.,}}.....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001284303.2 NCBI
GGAAGAGCUUCUCGGCUCUAGGCUCUGGAGUCCCGGGAGCAGUGAGGGG… 3524 nt 0.5911
NM_001284304.2 NCBI
GGAAGAGCUUCUCGGCUCUAGGCUCUGGAGUCCCGGGAGCAGUGAGGGG… 3895 nt 0.5931
NM_001284305.2 NCBI
CUGUUUGAACUCAGGCUGCUGCCUGCUGGGCCUGCCUGCCCUUGGAGCC… 3697 nt 0.5894
NM_001410803.1 NCBI
GGAAGAGCUUCUCGGCUCUAGGCUCUGGAGUCCCGGGAGCAGUGAGGGG… 3581 nt 0.5909
NM_014346.5 NCBI
GGAAGAGCUUCUCGGCUCUAGGCUCUGGAGUCCCGGGAGCAGUGAGGGG… 3758 nt 0.5934
Summary

Enables 14-3-3 protein binding activity and protein homodimerization activity. Predicted to be active in Golgi apparatus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.