Basic Information

Symbol
BCL9
RNA class
mRNA
Alias
BCL9 Transcription Coactivator B-Cell CLL/Lymphoma 9 Protein B-Cell Lymphoma 9 Protein Protein Legless Homolog B Cell CLL/Lymphoma 9 Bcl-9 BCL9, Transcription Coactivator LGS
Location (GRCh38)
1:147541501-147626216
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004326.4
Sequence length
6189.0 nt
GC content
0.5300

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2141.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2261.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1501.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004326.4 NCBI
AGACCAGAGCAGACAAUAGGCCCCUAAAGUGUUCCCCCUAAGUUGCUUU… 6189 nt 0.5300
Summary

BCL9 is associated with B-cell acute lymphoblastic leukemia. It may be a target of translocation in B-cell malignancies with abnormalities of 1q21. Its function is unknown. The overexpression of BCL9 may be of pathogenic significance in B-cell malignancies. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the BCL9 was upregulated during continuous weight loss from 5 to 12 months in weight losers, as identified through gene expression analysis of subcutaneous adipose tissue [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].