Basic Information

Symbol
BCL9L
RNA class
mRNA
Alias
BCL9 Like DLNB11 Bcl9-2 B9L B-Cell CLL/Lymphoma 9-Like Protein B-Cell Lymphoma 9-Like Protein B Cell CLL/Lymphoma 9 Like BCL9-Like Protein Protein BCL9-2 Nuclear Co-Factor Of Beta-Catenin Signalling
Location (GRCh38)
11:118893875-118925926
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001378213.1
Sequence length
7598.0 nt
GC content
0.6369

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3368.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3490.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1660.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001378213.1 NCBI
AUUCAGGCUGGGGAGUGGAGCCGAGUGGAGGGGCAAGCGAGGCUCCGGC… 7598 nt 0.6369
NM_001378214.1 NCBI
AUUCAGGCUGGGGAGUGGAGCCGAGUGGAGGGGCAAGCGAGGCUCCGGC… 7496 nt 0.6369
NM_182557.4 NCBI
AGAAGAGCCCAGCUGCAGCCCCGGGGCCCCGCCAGGCCUCUCGCUGCCC… 7382 nt 0.6322
Summary

Enables beta-catenin binding activity. Involved in several processes, including negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in fibrillar center and nucleoplasm. Part of beta-catenin-TCF complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human patients identified the BCL9L as a potential biomarker for myocardial fibrosis after acute myocardial infarction, where it was part of a ceRNA network involving GAS6-AS1/SNHG22 and hsa-miR-135a-5p [Wang et al. DOI:10.2147/IJGM.S329391].