Basic Information

Symbol
TCF23
RNA class
mRNA
Alias
Transcription Factor 23 BHLHa24 OUT Class A Basic Helix-Loop-Helix Protein 24 TCF-23 Class II Basic Helix-Loop-Helix Protein TCF23 BHLHA24
Location (GRCh38)
2:27149004-27156974
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_175769.3
Sequence length
4882.0 nt
GC content
0.5344

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2180.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2262.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1107.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_175769.3 NCBI
GAGUUGGCGCCAGCUUCCUCGGAUGUAGAUAUUGCUGGCUGGAUGACCA… 4882 nt 0.5344
Summary

The gene encodes a member of the basic helix-loop-helix transcription factor family. Studies of the orthologous gene in mouse have shown the encoded protein does not bind DNA but may negatively regulate other basic helix-loop-helix factors via the formation of a functionally inactive heterodimeric complex. [provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

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