Basic Information

Symbol
TCF25
RNA class
mRNA
Alias
TCF25 Ribosome Quality Control Complex Subunit Nuclear Localized Protein 1 KIAA1049 Nulp1 Transcription Factor 25 (Basic Helix-Loop-Helix) Ribosome Quality Control Complex Subunit TCF25 TCF-25 Transcription Factor 25 HKIAA1049 PRO2620 FKSG26 Hulp1 NULP1
Location (GRCh38)
16:89873566-89913627
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014972.3
Sequence length
2248.0 nt
GC content
0.5912

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-886.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -920.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 462.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((((((((((..((....))..)))(((((((((((((((((((.((((((..((((.((((..((((((((((((((((((..((((((.(((((..((((.(((.((((.((.((((...)))))).).))).)))..(((..((((((((..........))))).))).)))((((((((((....)))))).)))).((((((..((((.((((((.((((.(((.(((..(((((.....(((...))).........)))))((((((((((((.((...((((((.....(((.(((((((((((((....)))))..((((((((.((((((.....(((..((((((((((((....))).(((.(((...(((.((.......)))))......))).)))......(((((.(((..(((((...((((........................................(((((..((((((....................)))).))(((((....)))))...........((((((((........)))))))))))))(((.((((((.(.((........)).).)))))).))).((((.((((((.................)).)))).))))((((((....)))))))))).....))))).))))))))..(((((((((.....)))))))))))))))).))))).....).)))))....))))))))...)))))))).))).((.(.(((((((................((((((((.(((......))).)).))))))..))))))).).))......(((((((((((((((((...)))))..)))).....((.((((((...((((.....))))....)))))).)).....((((((...(((((((........)))).....)))...))))))..((((((((((.((..((.((((((((((.((((..((((((....))))))....)))).))))....(((((.((.....)).)))))......(((((((((((..((((........))))...))).....((((....(((((.....)))))....))))..((((...)))).)).)).))))..)))).))))))))))))))))....((((....))))(((((((((..............((.(((((...))))).))......((((((((..((((((..(((((((((..(((((((....(((..(((...))).)))....((((((((.((((((((((((((.((.....((((((...))))))....))...))..)))).)))))))).......))))))))))))))))))))).....((((((..((((..((.(((((((.((((..((((...(((.........((((.(.(((((.......((((((((((((...........)))))...)))))))......))).)).).))))(((.((((((((((((..(((...((..(((((((...)))))))..))..)).)..))))......))))))))..)))(((((.((...)).)))))))).)))).)))).)))))))..))...))))..))))))..)))..))))))))))))))...))))))))).))))))))...))))))...)).))))))...))))))..))).))).)).)).))))))))))))))))..(((((((...)))).))).))))..))))).))))))(((((((.(...((((((((.(.((.((((.((.(((......))).)).((.((((.....)))).))((((((((((((((....(((....)))...)))..))))))))))))))).)).).))))))))...)..)))))))........)))))))).((((.(.......).))))))))))))))...(((....((((...........))))))))))).))))..))))))))).))))))))))))).)))...(((((((..((..(((.........)))...))..)))))))((((((........)))))).))))))..).))))))..((((((((((..((((.(.(........).)))))))))).)))))................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{{,.((((({|((((((,((.,({....)},,}}|(((((((((((((((((((.((((((..((((.((((,.((((((((((((((((((..((((((.(((((..((((.(((.((((.((.((((...)))))).}.))).)))..(((..((((((((.,........)))))},)).)))((((((((((....)))))).)))).(((((({((((({{,((((.{(((.(((.(((,,(((((,....{({,,,||,.}.......}))}}{{{||||{(({{.{{...((((((,..{{(((,(((((((((((((....)))))..((((((((.((((({.....(((..((((((((((((....))).(((.(((...(((.((.......)))))......))).)))......(((((.(((..(((((...((((........................................(((((..{{,(((,....|,............}}}}},||{((((....}})))},,,,....,.((((((((........)))))))))))))(((.((((((.(.((........)).).)))))).))).((((.((((((...,.......}}....)).)))).))))((((((....)))))))))).....))))).))))))))..(((((((((.....)))))))))))))))).))))).....}.)))))....))))))))...}}}})))),)}}..{{||{{{||{{,,,.......,||||||||||{{{.(((......))).}|,}}}}}}..,,.,,})))),.,,.,..|||||{|||||||||((.{({,.|(((((.((((.,(...||,)))).)))))},,,}},}},,,}))))),)),,,,.{((({(...(((((((........}))}.....)))...))))}}.,((((((((({{((({((((.((({((((.((((..((((((....))))))...,||||.}}}}||}.,,,,{.((,.{{{||{|,,,,....}}}})).)}}.,|..{{||.{...,,.}}}},.,}}}}}}.,{{,{{{{{|{{{,.,,,,}..||.,||{|,((.((((...)))).)),)),},)),}))))})),}))))))))))))}...((((....))))(((((((((.,,...........((.(((((...))))).))......((((((((..((((((..(({((((((..(((((((....(((..(((...))).)))....{(((((((.((((((((((((((.(,.....((((((...))))))..,,},..,)}..)))).)))))))).......)))))))}))))))))))))).....((((((..((((..((.(((((((.((((..((((...(((.........((((.(.(((((.......((((((((((((...........)))))...)))))))......))).)).}.))))(((.(((((((({(((..,{{.,.{{..{{{|{||...,||||||,.,),.)),)...,,)},},..}))))))).,}))(((((.((...)).)))))))).)))).)))).)))))))..})...))))..)))))),.))}..))))))))))))))...))))))))).}}}||}},..,)}})})...}),))))))...))))))..))).))).)).)).))))))))))))))))..(((((({...}))).))).))))..})))).)))))){((((((.{...((((((((.(.((.((((.((.(((......))).)),((.((((.....)))).))|(((((((((((((....(((....)))...)))..))))))))))})))).)).).))))))))...,,.)))))))........)))))))).((((,(.......),))))))))))))))..,||,..{,((({..,,...,...)))))),)))).))))..))))))))).))))))))))))).)))}..(((((((..((..(((.........)))...))..)))))))((((((........)))))).))))))..},})))))..,(((((((((.{(,,,.,}|}}}}}}}}},,}))}},,,,.|||||........})))}...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014972.3 NCBI
GUGCGCAGGCGCGCCGACAGCCGAGUUUUCUGCGCUUCCUUCUCCCUCU… 2248 nt 0.5912
Summary

TCF25 is a member of the basic helix-loop-helix (bHLH) family of transcription factors that are important in embryonic development (Steen and Lindholm, 2008 [PubMed 18068114]).[supplied by OMIM, Sep 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.