Basic Information

Symbol
TCHH
RNA class
mRNA
Alias
Trichohyalin THH TRHY THL UHS3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_007113.4
Sequence length
6985.0 nt
GC content
0.5602

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2308.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2415.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1970.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((((.((.....((.(((((..(((((((((((.((((((((....)))))...(((......)))...........(((((.((((((....((......(((((.(((((.........))))))))))((((.((.((((......((.((.((..((........((((.....(((((((.....((..((((((((...))))))))..))......((((....((((....((..(((((.(((((((.((..((((((((.....)).))))))..))......(((((((.((((.(((((....((((((...((((((.((.((((((((.((((.((...)).)))).)))).....((((......((((((((..........))))))))...)))).(((..(((.....((...))...)))..)))((((.........))))........((((.(......).)))).......)))))))))))).....))))))((((.....(((..((...((.....))....))..)))...))))(((((..((((((((((.(((......))).)))))...(.((....)).)....((((........))))((.........)).)))))...)))))....(((..((((((....))))))..)))....(((..((((....))))..))).(((((((............(((((..............((....))....)))))..........))))))).........))))).)))))))))))((((......))))(((....))).....))))))).)))))..))..(((((..((((......((((((....))).........)))......))))..)))))....))))...)))).(((((((..(.....((.((..((((....))))..))))......)..))..)))))......)))))))....((....))..))))))..)).))))..)))))).)))).((((.................))))..((..((((((..((.((.((..........)).)).))..))))))..))))...))))))..))))).((.((.((..((((((..((.((.((.............)).)).))..))))))..)).)).))..((((((..((.((.((..((((((..((.((.((..((((((..((.((.((..((((((..((....))..))))))..)).)).))..))))))..)).)).))..))))))..)).)).))..))))))...))).)).)))))))))...)))).).))....((.((.((.......)).)).))..(((((((.((((..............))))..)))))))..((.(..((((((((((((((..(..((((((....(((((...((((.((((..((((..((....))((..(..((.((..(.((..(((..(((((.(............).)))))..)))..)).)..)).))..)..))...((....))..........))))...)))).))))..)))))....((.(((((((((((((((((....)))..)))))((((....((((((((...((((((.(.((..((((...((((((((...((.((((............)))).)).......(((....((((((((((.((((..............))))..))))))))))...)))..........((((((..(..(((((...((((...(((.....(..(((((.((..(..((...((.((((............)))).))...))..)..)).)))))..)..)))..))))....)))))..).......))))))..(((((((((....(((.....(..(..(....(((((............)))))...)..)..).....)))...)))))))))..((.((((...............)))).))))))))))..))))((((.(((((..(((((((((.(((....))).(((((......(((((((......(((((((((........)))).)))))..(((((.((.((.(((.....((...((((.....))))...))...((((.((((..(((((((((...((..((((...(((((((((..................)))))))))...........((((....))))............((((.(((((.((.((..........)).)))))))..((((.(.((.(...).)).).)))).....))))......(((((.(((...))).)))))..)))))).))))))).))..))))..)))).((((..((((.....).)))..))))........(..((((((((....).)))))))..).))).)).)))))))..((..(((((((((..((((..((((...(((((((((.....((.((((((((.......))))).))))).....)))))))))..(((((....))))).((((((((((...(((.((((..((.....))..))))....(((....))).((((((..((................))..)))))).....(((((.((....((..((((.....((((((((..(......)..)))))))).....))).)..))....)))))))...........((((((((((.((((.(..(((((.(((((((....(((((((....(((((((((.............)))))))))...........((..............))((((((((((((((((.....((((((((((((((((.((((((..(......)..)))))).)...((..((...........))..))....((((...........))))...............((((((..(......)..)))))).............((((((.((((.((..((((((((.((((((((..(((......).)).)))))(((((............)))))..((((.....(((((((((((...((((.......))))....(((((((((((.....((((((...(((((...((((.(((((.((((........((.....))........)))).)))))....((((((((((........((.((((((.............)))))).))......((..((...........))..))(((.((((((.(.....).))((((((....(((((.(((...(((.(..(.((((..(((((..(((...((((.....(((((.((((....(((((...(((....((........))...((((((((.(((((((..((((((((((.....((..((...........))..))....((((.((...(..(.((....)).)..)...)).)))).((.((....((((((((((.....(((((.........(((((..(((((............................))))).)))))..........((.(((((.((.......))))).)))).....((((.....(((((..(((((..............................)))))))))).....))))...........))))).((((((((.......))))))))...........((((.(((.....))).((((((((((........((....(((....)))..))..........((.((((((((.((((....(((.((((((((..(.....)..)))).((.......))....))))))).....))))(((.....)))((....))....((((((((((............................(((........)))......((((.(...((((((...((.((((.(.....((.((..(((((((((..((.((..((..(((.(((....((((.......))))))))))..)).......(((((.....)))))...)).))..)))))))))..)).)).....).))))))....))))))...).))))))))))))))))))))))..))(((.((..(((((((((.....(((((...........)))).).....)).))))))).)))))..................((((.......)))))))))))))).((.(((((((............))))))).)).(((...(((((((..((....(((.............))).....))..))))))))))......))))....)))))))))).)).))..((..(((.(((....((((((...(.((((......((((((.((.....))))).)))....)))).)...))))))))))))..)).................((((((...))))))))))))))))...(((......)))........)))))))..........(((((((((((((..(..((....))..).)))))((((......)))).......(((((..((.((..(((((((...................)))))))..)).))....))).)).......((((.......))))......((.((((.(((.(((............))).))).)).)).)).))))))))(((........)))........)))))))).....((((...........))))..((((.....(((((((................((((((((..(((...(..((((((......((((((...))))))..((((((((((.((.....))))).....)))))))))))))..))))........((((((.....((..((((((((((((.....((.((..((((.((((..((.((....(((.((........)))))...((((((......(((((((....))..)).)))......))))))..)).))..)))).))))..)).)).....))))))......((((....))))...))))))..)).....)))))).....))))))))...((((((...............(((....)))...((..((((((((((....(........((..((((((.(((.(((((((..........(((....((((......))))....)))..(((.((..((((.((((..(..((.....((((.(((....((((....))))......))..).))))....))..)..)))).))))..)))))..(((((..((.....))..))))).........)).)))))..((((.....))))......))).)).))))..))........)....))))))))))..)).((((..((((.(.((......)).)))))..)))).....)).)))).......)))))))...)))).((......))..............(((........)))))).)))))...........((..(((.((.((......((((.......))))......))..))))).)))))).)))))....))))...))).))))))))))..).)))...))))))))...))))))..((((....((........))...))))...)))))))....))))))))))....))))....)))))...))))))...((((.....((.(((((((((((((...........)))))).))))))).))))))......))).))))))))......)))))))))))....))))...)).).))))))))..)).)))).).))))))))))))))))))))....(((((.....)))))....)))))))))..))))))).((((((.((...)).))))))..........((((((......))))))...........((((((((...((...((((((((((((((...........))))))))).)))))..))...))).)))))(((((((((((........))))))))))))))))))...)).......)))))..)))))..).)))).))))))))))..)))...))))).....)))))...)))).)))).))))))))))).((((((.(..........).)))))).....................(((((((((......)))))))))......)))))))....)))))(((....)))......(((.(((((((....((((.((.((((((((....(((((((...))))))))))))))))).))))...))).)))).)))..(((((.........))))))))))))))..)))))..))))...........)).).))))))...)))).)))))))).)))).)))))))..(((((((......)))))))........(((((..((((........)))))))))...)))))).)..)).........)))))))).)))).).))......)).)))))).((((.(((((.(((((((....(((..(((((.((......((((((............)))))).......)).))))).)))...((((............)))).))))))).))))).)))).(((.((....)).))).........................)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((,{{((({({.,,..||,|||{{..{(((((((((((((,{({((,,,,|}}}|...|{{......}}}.........,,(((({,{{{{(({{{.,{.{{,{{{{{{{,|{(((.....,,..|||}}}}|||{{{{,{|.{{{({{{{,.|,.,}}}}..,,..,...,.||||.....(((((((....{({..((((((((...))))))))..)).,...,(({,....,|||...(((..(((((,((((((({((..((((((((.....)).))))))..))......{((((((,,{{{.{{(((.((((.((((..{.((.(((((.(((((((..((.{(({.((((.((.(.,.........).)))))).|{{{,({,........{{||||,},,.....}}}|||..,,,,,...{{...}}...))).{{{{((,,..,......|||.........((((.(......).)))).........)}}...,.,....}}).))).})),.))..)}}})))).))))).)).)..)))).)))),,.,,(({{..,..||{||(((((.(({......))).)))))...{.(,....}}.)....((((........))))((((..{.....)..))))..{(((((....(((..((((((....))))))..))).....)))))|((....)),...|||||||..}||,,}|,||,...{||{|.....,...},}},}}....}}....)))})....},,,,,}||||,,,,}}}),}.}}}},.}}}}))))))|((((......))))|((....))}.....})))))),)}})}..}},.{||||,,|{{|.......((((({{..,,..,..,....,)).,....}))),,))|||....))))}}}))),.{{{((|{,.|,..,.((.((..((((....))))..)))),,,{,,|..||..}}}||,,,||||||,|||{{{{({{(..,,.}|.,,.,,,|,,||||,.{{.,{.......||||..||.,|,|,.,..,,.|||({.((..((((((..((.((.((..........)).)).))..))))))..)),)|,||.|||||,||||{{(({(..{(,,({((((..((,({.{(.............)),)}.}),,)}))))..)),||.((..((((((..((.((.((..((((((..((.((.((..((((((..((.((.((..((((((..((....))..))))))..)).)).))..))))))..)).)).))..))))))..)).)).))..))))))..)).)}.}},{{|{{{{{{{((((.((.((....)).)}.)).,...,.,({(,.,{.|({{((,,.((((...{..........})))..|}|||||..}}}},.{({(({{,,{{{,,{(({{{{{{{,,..,{((((.,{(,,((((((,.,((({.((............}))))}..,.}}}}|||..||(({.{,.,,..,.,,,{|{|,,||.,|,,..,..||,||.||.,{..((...((....))...}}..,..{(((...((({{{||{..|||||....({,{.........||||.((.((({{{,.||.,....|..},,)}....}))..)).|,,,....)))))...)))))))))..}))),,{..,,,,..,,.{{{|,.{{.......||,.,,,|{({((((((.{{{{..,{....,,....||||..||||||||||..{|||..........,||||{..|}}|||||},.||||...({{.....{..(((((.((..(..((...((.((((....,.......)))).))...))..}..}|,}}}}|,,|,,|||..||||....}}||,..}.......}))))}..)}})))))}....}}}{{{..(((((((({{.(((((.,......},..))))).{(((((..({,..((((...((((.((({..{{.((((...............)))).})))).))))..))))(((({...,((((((((((((..((((((((((,,(((((((({({.{{.....{|,(((((((((........)))).)))))..{((((.(({((,(({.....((...((((.....))))...))...((((.((({..((((({({{...{{..{{{(...(((((((((..................)))))))))......,,..,((((..,,||}}..,,,,......,}||.(((((.((.((..........)).)))))))..((((.{.{.{(.||.||.,|{||,,.......}|......(((((.(((...))).)))))..)))|||.}}}}))).))..})))..}))).((((..{((|.....},}))..)}}|........|..((((((((....}.})}))}}..}..}}.}},))}))}}}.||.,|||.|,.||},|,,,..{(({{..{((((((((.....((.((((((((.......))))).))))).....))))))))}..|{||,...,|||||.,,,,..,,.,...,||,|||,..||}....)),})|||{|..(({....})).{|||||..{{................,}.,)))))).}.,}||{|{,||,..,||..|(((.,...((((((((..(......)..))))))))...,,))),|{{|,{{{{|,|||||{{,{,,{,{{{,,{{,,{{{,.(((({(..,,,,,..,,...,....((((,,{,...(((((((((..,..........)))))))))..........|||............|{||....|||,....|||..{(((.....)))}...((((((,,{..........})}))),((((........))}}.........|||||}....((((...........))))............{{.((((((..(......)..)))))).,,.,......,{,{{{{{{({|||||,.,,,((,(({({(,,..,.{(((........,|,{({|{{{({{........,,.}))}|||.{,,,.....,((((....,....||||.,..||.},,,.,||{(((((({({(,....((((((...(((((.,.{{({.(((((.((((........((.....))......,.)))).)))))....((((((((((...,,...((.((((((..,..........)))))).))......((..{(...........)).,)).{{.(((({{,((((,.{,{{{{{{{{....{{((({(({...{{,.,..,.||||,,(((((..(((...((((.....(((((.((((....(((((...(((....{(.....,....{{.((((((((.{,.{{....((((((((((.....,,..((...........||{{||....((({..,.}||....((.,..}}....|.,{(({{,||.{..{,....{|{{||{||{.........,.........|||||}.,{,((,,..,..{{.,,.((....,{,,.....})))).|||||......||..{{.{{{||.{{,,,,,..}},||.||||,{|,,{((....||((.((,{{((({.............,,.{{||{{.........,|||,||||....})))},,..}}},,}.))))}.||{||||{.,,,,,.}}}))))),),.......,})}}.{{,....,))).((((((((((........((....||,...,)}}..}}..........((.((((((((.{(((..,.(((.((((({{{.,|,....}..)))}.||,......}}....}}}}|||....,))))(((.....)))((....))....((((((((((..........................,,(((....}}}.},}......((((.{...((((({...((.((((.{.....((.((..(((((((((..((.((..{{,.(((.(((....((((.......)))))))))),.}}.......,((((.....))))),..)).))..)))))))))..)).)).....}.))))))....))))))...).)))}))))))))))))))))))..}){{{.{{..((((((({({....{((((.........,,)))).)...},,}.))))))).)))}),....,},,.........{(((.......)))})))))))))).((.(((((((............))))))).)).,,..,|||{|||||.((.,,,({(,,........,{{|,}.....)),,|||})))|||......}),.....}))))))))}.}|{|,....}}}||.|.,....{((((||.,{.{{,,.....|((((({,,(|....|||||,|||....|}}),}...,,))}}}}))))}})}.....,,..........{|||||..|)}|||,}}}}}})))).,,({{......))).,......,}|||||.,|,||,...(((((((((((((..(..((....))..).)))))((((......)))).......{((((..((.((..(((((((.,{................)))))))..)).))....))).)}.......{(((,,,....}))),.....({.((((.(((.(({............))).))).)).)).}).)))))))),||.}}.}},,))),.....},)))||||}....||||{........,|||}}}..((((.....(((((((.......,......,.((((((((..(((...{..((((((......{(((((...)))))}..((((((((({{((.....))))).....)))))))))))))..})))........,(((((.....((..((((((((((((.....((.((..((((.((((..((.((....(((.((........)))))...((((((......(((((((....))..)).)))......))))))..)).))..)))).))))..)).)).....))))))......{(((....}}}),,.))))))..)).....)))))}.....)))))))),,,{||,......|,.........((({...||,...((.{(({{{(((,,....}},.....,||,}||||.||.||,}}|,((({{{.,,...{((({{{.((.,{{{{.,(((({((.{{....{..((....((.,((((((((((.....((((.,......((((.((((..(({...{((.,,((,|.....|,.....},}).{|||{.},|||..(((((..((.....))..))))),,.......))})})))..)))).)))}......))))))))))}})))..))....))..)....)),)))))))..)).||||.}|,||},}||,.....))})))))..,,,,.....},.}))).......)))))))...)))).||.,,..,|,............},(((........)))))).)))))....,......{{..(((.((.((...{,.((((.......))))..},..))..))))).}})))).)))))....))))...))).))))))))))..).))),..)}))))))...))))))}.{({{....||.....,,,},,.}))),...))})))),...})))))))))....))))..,.)))))...))))))...|,{,....,((.(((((((((((((...........)))))).))))))).))))))}.....)))})),)),)}....,,)))))))))))....))))...,,.))))).)))}.,,}.))))))}))))),)))))}.}))))))))}.,))))))....))))..).))))))))))})))))|{,((((((.((...)).)))))).,,........,{{{,......|}}}}}}}........,(((((,{({{.{,.,.((((((((((((((...........)))))))))}}))))..,}...)))}))))){((((((((((........))))))))))},,}}},|{(((({....}))))))..,,)))..)))))).))))))))))..)))...,,,.}}.,,.)))))...,,)).)))).))))))))},}.|||||,,|....{{{{.{|{,,,,||.....,},....))).))}}.(((((((((......))))))))).....})))))))....})}))|,,....|}|{((....(((((((.,.}}}}}||,,..}}||{{{{{{{{{{..,,|,..}))))))))),,,,..)))..)))).))}...........(((((.........))))))))))))))..))))..,)))}...........})})})))})),).}))}...}))))).}))).)))))))..(((((((......)))))))........})))).}}..}}}}.)))))).....)}..))))))).,..}|||.......||||}}},.}|||,,{|{{,,{.,,|,.{{{{|,|||{.{{{{{,||(({((,,,.(((..,,{(({{{..,||.{(((((...,........)))))),......,)}),)))}))).},|||{|{{|{||..,,,},,,.}}})))},)))}}.}}}}}|||}|..,.}}}}),},.,......,..........,,,,,)))))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACACUUGCCUGUGGUGUCAGCAAGCACUGUCGACUUCUUCCUCUGGUGA… 6985 nt 0.5602
Summary

The protein encoded by this gene forms crosslinked complexes with itself and keratin intermediate filaments to provide mechanical strength to the hair follicle inner root sheath. The encoded protein also is important for structural integrity of the filiform papillae of the tongue. Defects in this gene are a cause of uncombable hair syndrome. [provided by RefSeq, Feb 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.