Basic Information

Symbol
TCHHL1
RNA class
mRNA
Alias
Trichohyalin Like 1 S100A17 THHL1 S100 Calcium-Binding Protein A17 Trichohyalin-Like Protein 1 Basalin Intermediate Filament-Associated Protein S100 Calcium Binding Protein A17 Trichohyalin-Like 1 Protein S100-A17
Location (GRCh38)
1:152084141-152089064
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001008536.2
Sequence length
3606.0 nt
GC content
0.4368

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-946.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1009.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 796.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001008536.2 NCBI
ACAGCCCGCUGCCCCACGUUCUACCUGCUCUCGCUUGUGAACUAGCCUC… 3606 nt 0.4368
Summary

This gene belongs to the S100 fused-type protein (SFTP) gene family, and is located in a cluster of SFTP genes on chromosome 1q21. Several members of this family have been implicated in the development of complex skin disorders. This gene is evolutionarily conserved; its expression appears to be hair-specific and spatially restricted within the distal inner root sheath of the hair follicle. It thus may have an important role in hair morphogenesis. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.