Basic Information

Symbol
TCTA
RNA class
mRNA
Alias
T Cell Leukemia Translocation Altered T-Cell Leukemia Translocation-Associated Gene Protein T-Cell Leukemia Translocation-Altered Gene Protein T-Cell Leukemia Translocation Altered Gene T-Cell Leukemia Translocation Altered
Location (GRCh38)
3:49412212-49416476
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022171.3
Sequence length
1930.0 nt
GC content
0.5378

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-718.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -749.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 703.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........(((((((((((((.((((..(((((((((((.((..(((.((((((.....))))))))).)))))..))))))))((((((.(((.((((...((.(.(((((((((....(((((((((((((..((((((((((.((....)).)))).)))))).((((((((.(...((((..((((((........))))))..)))).(((((.(((((...........))))).)))))..).))))))))(((((((.....))))))))))))))......((((((.....(((((((((.((((.(((((((((.(((((......((((..((((((((((((((.(((((..((((((((((((((((((((..((((((.((........)).))))))..)))..)))))))))....))))))))..((((((..((((((.((..(((((.....(((.((((...((((((((((((.....))))((((((........)))))).)))))))).(((((((.(((((((((((.(((((((..(((((((((.............)))))))))..))))))).)).))).)))))).)))))))...........((((.((((........)))).).)))..................)))).))).))))).)).))))))..)))))).((((((....))))))....))))).))))))))....(((((((.(((...)))...)))))))((((.((((....((((.......................((((.(((..(((((.....))))).....))).))))...((((((((((((..(((((..((((.......((((((..(((((((((((((((((....(((((....((((.(((.(((((.(((((((((((((((...((((..(((((....)))))..))))(((...)))((((((.(..(((((.(((((((...(((.(((.......))))))))))))))))))...).)))))).))))))))))))))).).......((((....))))(((((((((((....(((.(.....).))).....)))))...))))))......)))).))).)))).((((((.(((((((.((.((.((((......((((((((.((((((.((...((....))....)).))))))...(((((..((......((.....))......))..)))))....(((((((....((((((.....))))))))))))).(((..((((...))))))).((((((....((((.....))))...))))))))))))))........)))))).))...))))))).)).))))....)))))...))))....)))....))))))))))............((((.((((..((........))..)))).))))..))))))....))))...)))))..))))).......((((....))))..........(((((((((..(((((......((((((.(((....))))))))))))))..((((.(......).))))...)))))).))))))))))......))))...))))..)))).......(((((....))))).....)))))).))))........)))))..(.((((.........)))).)..))))))))).)))).....)))))))))..))))))..........)))))).....)))).....))))).).))...)))))))..)))))).......)))).)))).)))))).))).((((((..(((((......))).))..(((..........))).))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,{{,,.,(((((((((((((.((((.,(((((((({{(,((..(((.((((((.....))))))))).))}}),.}}))))))((((((.(((.((((...((.(.((((({{(({{{{(((((({((((((,{((((((((({.{(....}}.|))).)))))),((((((((.,...((((..((((((,......,))))))..)))).(((((.(((({,,,{,....,|)}))).}))})..},))))))))(((((((.....)))))))))))))}......((((((.....{{(((((({...{({((((,{{(((({{(({{.{.,{(({...,.,{{((((({{||{||||..{(((((((((((((((({((,.((((((.((........)).))))))..)))..)))))))))....))))))))|,,,||||||||||{|,{||}||||{},,,.|||||,,|,,}||{{|||{({{{,{{,.||}|((((({..,,,.,,||||}}..}}))))))||,{((|,(((((((((((.(((((((..(((((((((.............)))))))))..))))))).)).))),}))))}.,))}}}}......,,}}}||||,{{{{{{{{{...,,))|},|},...............{{{||||{{||{{||||,{|{|||||,,||||}|..((((({....}))))),{,,,|||||||||{{||,,..({({{{{|{|,...|}||.|))))|)),...||||,...,|||||,.....................((((.(((..(((((.....))))).....))).)))){|||||(((.(,(((((({,,..}})))).}.}}},((((((((.(({{(((((........}}))}))).}})}.}})).||||||,,..||||)},,|||||.(((((.,((((,....)))))..)))))||,{{|,,(((({{,...,((((|{(((|||...{((|{{||||,,,,||}}}}|||}}|||,|||,||||,.{(((((((((((((.....)))}},}})))))))}..|||}{|||{{|{|{(.,,.{{{,{.....)})),.....))))),.,)))))}...,||{.(((((((({.|{..{,||}}}}}})),},,||.{|||,,...{{{||{{{{.((((((.{{,|.|{|...}},..})).))))))....(((,,{{,.,..,||||.,{{{|......,,...,,{,,.}|||,,,{{{{{((((({({{{{.,,,,|||,,|||}||||{{,,}||||((((((....))))))..((((.....)))){,.((((((({(((((.(((((..,{{{.....,...}|((((..(({.((((...))))....)))..))))).,,,..))))),)))).}},}})))))..}|,{,{({{({...,||,.}},.}))).})})||||}|,,,,..}},,...,}|,},,}}}}}}}},..,|||||{{,||||.{|,....,|{||||||||{,|||||,....,||||||,|{{...,)))))))))))))},||||,.}}||,|||||..|,,{|{{{||},}}}}}}.,...},})))))).,,))}},,))))})...,{|||{....)))))|,|,,..)})}))))))),,.,,}}}}},,.,.{||{.........}))}.,|||||}}}},,,},,,}}},,}))))))))}.)))))),.,,,.....)))))),...}))))}....))))}.).))...)))))))..)))))).......)))).)))).)))))).))}.|,,..,.{({(((......))).)).,|})}},.......{{{....)))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022171.3 NCBI
AGUCAUGGCGGAGUCCUGGUCUGGGCAGGCCUUGCAGGCUCUGCCGGCC… 1930 nt 0.5378
Summary

Involved in negative regulation of osteoclast differentiation and osteoclast fusion. Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.