Basic Information

Symbol
BDH1
RNA class
mRNA
Alias
3-Hydroxybutyrate Dehydrogenase 1 SDR9C1 BDH 3-Hydroxybutyrate Dehydrogenase (Heart, Mitochondrial) Short Chain Dehydrogenase/Reductase Family 9C Member 1 D-Beta-Hydroxybutyrate Dehydrogenase, Mitochondrial 3-Hydroxybutyrate Dehydrogenase, Type 1 EC 1.1.1.30 Short Chain Dehydrogenase/Reductase Family 9C, Member 1 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein (R)-3-Hydroxybutyrate Dehydrogenase 3-Hydroxybutyrate Dehydrogenase EC 1.1.1
Location (GRCh38)
3:197509776-197573382
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_203314.3
Sequence length
3527.0 nt
GC content
0.5608

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1348.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1407.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1019.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004051.5 NCBI
GUAGAAGCGUCCGGGUGGCGGAGGCCGCAGGCCGCAGGAGUGCUGGUGG… 3375 nt 0.5615
NM_203314.3 NCBI
GUAGAAGCGUCCGGGUGGCGGAGGCCGCAGGCCGCAGGAGUGCUGGUGG… 3527 nt 0.5608
NM_203315.3 NCBI
AUUCUCAGCUAAAGGCAAGCAUUGAAAGAAUACACAGAAAGCCUGGAAA… 3350 nt 0.5490
Summary

This gene encodes a member of the short-chain dehydrogenase/reductase gene family. The encoded protein forms a homotetrameric lipid-requiring enzyme of the mitochondrial membrane and has a specific requirement for phosphatidylcholine for optimal enzymatic activity. The encoded protein catalyzes the interconversion of acetoacetate and (R)-3-hydroxybutyrate, the two major ketone bodies produced during fatty acid catabolism. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the BDH1 was under-expressed in liver tissue following exposures to α-particles from Kupffer cell-specific, endothelial cell-specific, and neutron irradiations, as well as γ-ray exposure [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].