Basic Information

Symbol
TDRD9
RNA class
mRNA
Alias
Tudor Domain Containing 9 C14orf75 NET54 Tudor Domain-Containing Protein 9 ATP-Dependent RNA Helicase TDRD9 DKFZp434N0820 FLJ36164 Putative ATP-Dependent RNA Helicase TDRD9 Chromosome 14 Open Reading Frame 75 Hypoxia-Inducible HIG-1 EC 3.6.4.13 EC 3.6.1 SPGF30 HIG-1 SPNE HLS
Location (GRCh38)
14:103928456-104052667
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_153046.3
Sequence length
4788.0 nt
GC content
0.4603

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1544.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1632.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1126.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_153046.3 NCBI
GUUCCCGCCGCGGAGACCCGGCAGUUGGGGGAUGCCGACGCCUGGGCCU… 4788 nt 0.4603
Summary

Predicted to enable ATP hydrolysis activity; RNA binding activity; and helicase activity. Involved in spermatogenesis. Located in cytoplasm and nucleus. Implicated in spermatogenic failure 30. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that peripheral blood mononuclear cells from sepsis patients exhibit a distinct transcriptome profile with 1639 differentially expressed genes [Wu et al. DOI:10.7150/ijms.46910].