Basic Information

Symbol
TEAD3
RNA class
mRNA
Alias
TEA Domain Transcription Factor 3 TEA Domain Family Member 3 ETFR-1 TEF-5 TEAD5 Transcriptional Enhancer Factor TEF-5 DTEF-1 TEAD-3 TEF5 Transcriptional Enhancer Factor TEF-5 (DTEF-1) Transcriptional Enhancer Factor 5 TEA Domain Family Member 5
Location (GRCh38)
6:35473597-35497079
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003214.4
Sequence length
2986.0 nt
GC content
0.5981

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1221.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1269.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 960.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001395214.1 NCBI
AACACAAACUUUCCGUCCCGCUCGCUCCCUCCUCCGCGCUCGGCGCCUC… 2986 nt 0.5971
NM_003214.4 NCBI
AACACAAACUUUCCGUCCCGCUCGCUCCCUCCUCCGCGCUCGGCGCCUC… 2986 nt 0.5981
Summary

This gene product is a member of the transcriptional enhancer factor (TEF) family of transcription factors, which contain the TEA/ATTS DNA-binding domain. It is predominantly expressed in the placenta and is involved in the transactivation of the chorionic somatomammotropin-B gene enhancer. Translation of this protein is initiated at a non-AUG (AUA) start codon. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.