Basic Information

Symbol
TELO2
RNA class
mRNA
Alias
Telomere Maintenance 2 KIAA0683 HCLK2 TEL2 Telomere Length Regulation Protein TEL2 Homolog Protein Clk-2 Homolog TEL2, Telomere Maintenance 2, Homolog (S. Cerevisiae) TEL2, Telomere Maintenance 2, Homolog EC 1.1.1.27 EC 2.7.11.1 CLK2 YHFS
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_016111.4
Sequence length
3314.0 nt
GC content
0.6632

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1622.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1672.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 925.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.((((((((((((.(((.(((..(((......)))..).)).))).......(((((((...(((((((..(........)..))))))).(((((((...(((((..(((.(((.((((.........)))).))).)))))))))))))))..(((.(((((((........))))))).)))....((((((..(((((((......))))))).)))))).(((((((((((...((..(((((((((.(.(((((((.(((((((....)))))))....((..((((..((((((.((((((((....(((.(((.((((.(..((((......(((((((((.......)))))))))......))))..).))))..))).)))))))))).).))))))(((((((((...(((((((((..((.(((......))))).)))))).)))((((((((((((...((((((((((((....))))))(((((((((.((((.(((((((((........).)))))))).)))).(((....)))(((((((.(((.(...((((((.((((.((....)).))))..)))))))))))))))))((((..((((((.((....))))).)))..))))(((((....))).))(((((((((((.((((.((((..((((((..((.(((((((((...((..((.(((.((((((((..((.(((((..(((((((((((.((.((((((..((((((......))))))((((((((((((((((((((((....))))))))).(((.((....((((((((.....)))).))))....)).))))))))))))))))..((((.....)))).(((((((((..........((((((.(((.((((((.(((((.((....(((((....)))))..((((((((((....(((((((((((((..(((((((((((..((((...((((.......))))((((((.(((((....)))))))))))))))...)))))).))))).((.(.(((((.(((.(...(((((.(((..(((((.((((((((((...((.((((....(((((((((...))))))))))))).))....))))))(((((.((......)).)))))..........))))..)))))))).).))))...).))).))))).)))((((....)))).......)))))).))))))))))))))))).....)).))))).)))..))).))).))))))....))).)))))).))))).)..)).)))).)))))))((((((.((((...)))).....((((((((((((...(.(((((.((.((..((((.(..(((.(((.((..((.(((.((((......)))).)))))...)).))).)))..).)))))).)).))))).)...)))).))))).)))))))))...........((.(((((.......))).)).)))))))(((......)))...))..))))))))))).))..)).)))))))))))..))))))...)))))))).)))..)))).))))((.((((....))))))..)))))))))..(((...)))..((((.(......).)))).....(((..(((.((....)))))..))).))))))(((((.(.((.(((.(((((((............((((((((((((.....)).))))))))))..((((.....)))).((((....))))..))))))).))).)).).))))).....))))))))))))...)))))))))))))..))(((((((((((....))))))).....)))).(((..(((((..((.(((.(((.(((.....))).))).((((((....)))))).((((..((((.(((((.(((.((((...(((((((.(......))))))))(((((((...))))))).....(((((.....)))))...)))).))).))))).))).)..)))).....(((((.....((((((((((....))...)))))))).....))))))))))..)))))...)))))))))).).))))))))).))...)))))))))))..((((...((.((.((.(((((((((((((....)))))......)))))).)))).)).))..)))))))))))))))..))))).))).))).((((((....((((((((((((((.((((...((..((((((((.((((((((((.(..(((((...........((((((((.((.........(((((.....(((..(((((..((((.(((((...((((..((....))..)))))))))..)))).)))))..)))(((((((.((...((((((....(((.(.(((((.....(((....))).....))))).).))).))))))...)).......((((((...(((.........))).))))))))))))))))))..)).))))))))...........)))))..).)))))))))).)).))))))...))))))..)))).))))))))))..(((.(((((((.....((..((.((((.....)).))))..)).......)))))).).))).((((((((((..((((....))))..............((((.((((((((((...........(((..(((.((...(((((((((((((((((........))).((((((((.((.(((((((((..(....)..)))))))..(((((((((((.(((((((....(((((..((((.....)))).)))))..))))))).)))))..)))))).......)).))))).))))).........((((((.(((((((((..(.(((((((((((((((((((((.((((((.((((((((..(..(((((((.((((((..((((((((((..((......))..))))).)))))((.(((........))).))......))))))...(((((((....))))))).)).)))))..)...)))))))).)))))).))))...)))))....)))))))).)).)).)..)))))))))..))))))...))).).)))).))))))..)).)))..)))))))).)))))..))))..)))))))))).........)))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,({{.{(((((((((((.,(({{{((((((.{,{{{{{|{{|{,,.,||{|{{{..,,(((((...(((((((..(........)..))))))){(((((((...((((,.((((.(((.((((.........)))).))).))))})))))))))),}{|{}|||||||}}}}...,))))}}}.))),,,}((((((..(((((((......))))))).)))))).(((((((((((...((..(((((((((.(.(((((((.(((((((....)))))))((((((.((((({({(((((,{(((((({...{(((.(((.((((.(..((((.{....(((((((((.......))))))))).,..,.))))..).))))..))).)))))))))).),))||||(((((((((...(((((((((,.((.{{..,,....))}}.)))))).))|((((((((((((...((((((((((((....)))))}{(((((((({((,((({{,,{(({,((.((((((((((.,,,.))))}}}}}}}.||,(((({({{(({.{,..{(({{{.{{{{.((,,,,|}.}))),,))))))})}))))))))|||||.{{|||||.,,....,||},}}}|||||}||{|{,,.,|||,||{||{(((((((,((((.((((..((((((.{((.(((((((((...((..((.(((.(((((((({(,((((,((((((.((((((({,((((((.((((((((((.....,|}}|((((((((((((((((((((((((....))))))))),(((.({,{.{((((((((.....)))}.))))}}.})).))))))))))))))))))|(({.....}))},((||{{{{((((,,{{,{,({{({{,((({,{.((({({{||.}}...}}}||.}.,|))}))},)|||||})}|,}}}{((((((((((((..,,,,|||}|)|,)))|)},,}))))).}))}))))).}}})))}))}).)))),)),,||||||,}..,,|||||{,,,||((,.(.(((((.(((.{...(((((.(((,.(((((.((((((((((...((.{{((,...(((((((((...)))))))))}}}),)}....))))))||{((,((..,,..||,|}}}}}}}},},}},)))}..)))))))).).))))...}.))).))))).),,||||.}}})))}..((((((((,((((||.,||||.|(((,({{((.{{{...||}|}||..(({{..(((({(|,{{{...,)))},,}},)))).))))))))).}))),))))...}}}),))..))))))))..{{{(((((((((,..,.(((((.((.((..((((.(..(((.(((.((..{{,(((.((((......)))).))))}...)).))).)))..).)))))).)).))))).}.,.)))).))))),))}{|.|||{,.||,,..,..))))})}.}}}}}),,,(((((...))))),....,,,.....}}..))))))))))).))..)).)))))))))}),}))))))...)))))))),||},,||}|,||}||,.((({{{.{||..,,.)))})),))).,|(({{.,,,..||||.,......||||}}.,...|||}.,||}|{},,})))},..}}),))))))(((((,(.((.(((.(((((((.,,........,|(((((((((((,....)).)))))))))}..((((.....)))).((((....))))..))))))).))).)),).))))).....)))))))))))),..)))))))}}|}}}}.{{((,,|||||||}}}})))||||.....)))).||,{{((,(({{({,,,,.)})),)}}})).))))))|.((((((....)))))).((((.,,(((.(((((.(((.((((...(((((((.(......})))))))(((((((...))))))).....(((((.....)))))...)))).))).))))).))).}..))))..,.{(((((({{((((((,((,(,{(({(...})))),)}}.,...})))))),,))})))))..,),,))))))).).))))))))).,)}..)))))))))))..{{{{...{(,((,({.(((((((((((((....)))}},..,,|||||}}.)))).)),}}..))))))))))))}}))}))))).))).)}}.{{{{{{....((((((((((((((.((((..,((..((((((((.((((((((((.{..(((((.......,,,{,(((((((.{{.,{{{{,,{({{,,...,,((,.,{{|||.,||{{.{{(((...{{{{.,||....)),,)))))}}}),,)))).,)))),}}||(((((((.((...((((((,{..{{({({(((((,....(((....)))...,}))))).}}))),))))))...))...,,{{((((((...,.|,..}}}}).))).,}},,,)))))))))}||,,|,.}})))))}........,..)))))..).)))))))))).)).)))))),}.}}))))..)))).))))))))))..(((.(((((({,,,..((..((.((((.....}).))))..)).,,.,,,)))))),}.))).{{((((({((,,((((..,,)))}...,,........}|{|{,{((((((({{.,,,..,..,,{((,,({({(({..((((((((((((({(((........))).((((((((.((.(((((((((..(....)..)))))))..(((((((((((.(((((((....(((((..((((.....)))).)))))..))))))).)))))..)))))).......)).))))).))))).........((((((.(((((((((..{.(((((((((((((((((((((.((((((.((((((((..(..(((((((.((((((..((((((((((..((......))..))))).)))))((,(((,,,,....))).)).}))..))))))...(((((((....))))))).)),}))))..)...)))))))).)))))).))))...)))))....)))))))).)).)).}..)))))))))..)))))),.,))),).}})).))))))..))))))..)))))))).))))}..))))..))))))))))........,)))))}.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCAGAUGCGCCCUCCCGCCUGGCGUCCUCCGCAGAUUCGCGCUGAGAGG… 3279 nt 0.6636
GCAGAUGCGCCCUCCCGCCUGGCGUCCUCCGCAGAUUCGCGCUGAGAGG… 3314 nt 0.6632
Summary

This gene encodes a protein that functions as an S-phase checkpoint protein in the cell cycle. The protein may also play a role in DNA repair.[provided by RefSeq, Mar 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.