Basic Information

Symbol
TENM3
RNA class
mRNA
Alias
Teneurin Transmembrane Protein 3 Ten-M3 KIAA1455 TEN3 ODZ3 Protein Odd Oz/Ten-M Homolog 3 Tenascin-M3 Teneurin-3 Ten-3 TNM3 Odz, Odd Oz/Ten-M Homolog 3 (Drosophila) Testicular Tissue Protein Li 195 Odz, Odd Oz/Ten-M Homolog 3 ODZ3-Like Protein MCOPCB9 MCOPS15
Location (GRCh38)
4:182143918-182803024
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001080477.4
Sequence length
10923.0 nt
GC content
0.4707

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3446.14 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3648.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3291.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001080477.4 NCBI
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NM_001415960.1 NCBI
AGACCCAGGCAACUUGGCAGCGCUGGGCUCGGUUCCUCACGGCCACAGC… 10378 nt 0.4689
NM_001415961.1 NCBI
AGACCCAGGCAACUUGGCAGCGCUGGGCUCGGUUCCUCACGGCCACAGC… 10351 nt 0.4693
NM_001415962.1 NCBI
AGACCCAGGCAACUUGGCAGCGCUGGGCUCGGUUCCUCACGGCCACAGC… 10348 nt 0.4693
NM_001415963.1 NCBI
AGACCCAGGCAACUUGGCAGCGCUGGGCUCGGUUCCUCACGGCCACAGC… 10330 nt 0.4699
NM_001415964.1 NCBI
AGACCCAGGCAACUUGGCAGCGCUGGGCUCGGUUCCUCACGGCCACAGC… 10327 nt 0.4698
NM_001415966.1 NCBI
CCUUUGAAUUUGGCCCGGCGCGGUGUGCGCGCGGCUCGGGCGGACGCGG… 10662 nt 0.4723
NM_001415967.1 NCBI
CCUUUGAAUUUGGCCCGGCGCGGUGUGCGCGCGGCUCGGGCGGACGCGG… 10686 nt 0.4718
NM_001415968.1 NCBI
CCUUUGAAUUUGGCCCGGCGCGGUGUGCGCGCGGCUCGGGCGGACGCGG… 10962 nt 0.4731
NM_001415969.1 NCBI
AGUCCGGCAAAUCCCAUUUGACAGAAAAAGGCAGUAAACGGGGAAUCUC… 11068 nt 0.4705
Showing 1 to 10 of 17 entries
Summary

This gene encodes a member of the teneurin transmembrane protein family. The encoded protein may be involved in the regulation of neuronal development including development of the visual pathway. Mutations in this gene have been associated with microphthalmia and developmental dysplasia of the hip. [provided by RefSeq, Jan 2023]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the TENM3 was identified as a high-confidence gene in common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].