Basic Information

Symbol
TET3
RNA class
mRNA
Alias
Tet Methylcytosine Dioxygenase 3 HCG_40738 Methylcytosine Dioxygenase TET3 Tet Oncogene Family Member 3 Ten-Eleven Translocation 3 MGC22014 Probable Methylcytosine Dioxygenase TET3 Putative Methylcytosine Dioxygenase EC 1.14.11.80 EC 1.14.11.N2 KIAA0401 BEFAHRS CXXC10
Location (GRCh38)
2:73984910-74108177
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001287491.2
Sequence length
12060.0 nt
GC content
0.5316

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4374.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001287491.2 NCBI
GAGUCCCGCGGACGCCUUCAUUGCUGCUGCUGCUGCCGCCGCGGCCGCC… 12060 nt 0.5316
NM_001366022.1 NCBI
GCAGCCGGCAGCUGGCCGCCGCCUCCUCUGCAGUGCCUCCCUCCGUGCG… 11195 nt 0.5237
Summary

Enables RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity; methyl-CpG binding activity; and zinc ion binding activity. Involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II and protein O-linked glycosylation. Predicted to be located in cytoplasm and male pronucleus. Predicted to be active in nucleus. Biomarker of esophagus squamous cell carcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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