Basic Information

Symbol
TFRC
RNA class
mRNA
Alias
Transferrin Receptor P90 CD71 TFR1 Transferrin Receptor Protein 1 T9 TR Transferrin Receptor (P90, CD71) CD71 Antigen IMD46 TRFR TfR1 Trfr TFR TfR
Location (GRCh38)
3:196012511-196082162
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001128148.3
Sequence length
5012.0 nt
GC content
0.4086

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1431.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1533.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1248.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001128148.3 NCBI
AGAGCGUCGGGAUAUCGGGUGGCGGCUCGGGACGGAGGACGCGCUAGUG… 5012 nt 0.4086
NM_001313965.2 NCBI
AGAGCGUCGGGAUAUCGGGUGGCGGCUCGGGACGGAGGACGCGCUAGUG… 4810 nt 0.4079
NM_001313966.2 NCBI
AGAGCGUCGGGAUAUCGGGUGGCGGCUCGGGACGGAGGACGCGCUAGUG… 4614 nt 0.4038
NM_003234.4 NCBI
AGAGCGUCGGGAUAUCGGGUGGCGGCUCGGGACGGAGGACGCGCUAGUG… 5224 nt 0.4219
Summary

This gene encodes a cell surface receptor necessary for cellular iron uptake by the process of receptor-mediated endocytosis. This receptor is required for erythropoiesis and neurologic development. Multiple alternatively spliced variants have been identified. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the TFRC was used as a reference housekeeping gene, with its presence indicating recovery of suitable RNA for analysis in a multiplex digital gene expression method for body fluid identification [Danaher et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2014.09.005].