Basic Information

Symbol
TGFBR2
RNA class
mRNA
Alias
Transforming Growth Factor Beta Receptor 2 TBR-Ii TBRII Transforming Growth Factor, Beta Receptor II (70/80kDa) Transforming Growth Factor Beta Receptor II TGF-Beta Type II Receptor TGF-Beta Receptor Type-2 EC 2.7.11.30 TbetaR-II TGFR-2 MFS2 Transforming Growth Factor, Beta Receptor II Epsilon Transforming Growth Factor, Beta Receptor II Alpha Transforming Growth Factor, Beta Receptor II Delta Transforming Growth Factor, Beta Receptor II Gamma Transforming Growth Factor Beta Receptor Type IIC Transforming Growth Factor, Beta Receptor II Beta Transforming Growth Factor-Beta Receptor Type II TGF-Beta Receptor Type IIB TGF-Beta Receptor Type II TGFbeta-RII EC 2.7.11 LDS1B LDS2B TAAD2 AAT3 FAA3 LDS2 RIIC
Location (GRCh38)
3:30606478-30694249
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003242.6
Sequence length
4530.0 nt
GC content
0.4702

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1470.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1550.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1090.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001407136.1 NCBI
ACUCGCGCGCACGGAGCGACGACACCCCCGCGCGUGCACCCGCUCGGGA… 4718 nt 0.4697
NM_001407137.1 NCBI
ACUCGCGCGCACGGAGCGACGACACCCCCGCGCGUGCACCCGCUCGGGA… 4245 nt 0.4735
NM_001407138.1 NCBI
ACUCGCGCGCACGGAGCGACGACACCCCCGCGCGUGCACCCGCUCGGGA… 4170 nt 0.4734
NM_001407139.1 NCBI
ACUCGCGCGCACGGAGCGACGACACCCCCGCGCGUGCACCCGCUCGGGA… 3660 nt 0.4541
NM_003242.6 NCBI
ACUCGCGCGCACGGAGCGACGACACCCCCGCGCGUGCACCCGCUCGGGA… 4530 nt 0.4702
Showing 11 to 15 of 15 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a transmembrane protein that has a protein kinase domain, forms a heterodimeric complex with TGF-beta receptor type-1, and binds TGF-beta. This receptor/ligand complex phosphorylates proteins, which then enter the nucleus and regulate the transcription of genes related to cell proliferation, cell cycle arrest, wound healing, immunosuppression, and tumorigenesis. Mutations in this gene have been associated with Marfan Syndrome, Loeys-Deitz Aortic Aneurysm Syndrome, and the development of various types of tumors. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been characterized. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A systematic review of human, mouse, rat, and pig tissues found that transforming growth factor beta receptor 2 (TGFBR2) mRNA is upregulated in skeletal muscle at 24 hours postmortem [Cianci et al. DOI:10.3390/ijms25158185].