Basic Information

Symbol
THBS2
RNA class
mRNA
Alias
Thrombospondin 2 TSP2 Thrombospondin-2 EDSCLL3
Location (GRCh38)
6:169215780-169254060
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003247.5
Sequence length
5701.0 nt
GC content
0.5120

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1984.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2091.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1425.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001381939.1 NCBI
GGCCACGUCCACCGGAGCAUCCUGCACUGCAGGGCCGGUCUCUCGCUCC… 5527 nt 0.5066
NM_001381940.1 NCBI
GGCCACGUCCACCGGAGCAUCCUGCACUGCAGGGCCGGUCUCUCGCUCC… 2879 nt 0.5863
NM_001381942.1 NCBI
GGCCACGUCCACCGGAGCAUCCUGCACUGCAGGGCCGGUCUCUCGCUCC… 6129 nt 0.5172
NM_003247.5 NCBI
GGCCACGUCCACCGGAGCAUCCUGCACUGCAGGGCCGGUCUCUCGCUCC… 5701 nt 0.5120
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the thrombospondin family. It is a disulfide-linked homotrimeric glycoprotein that mediates cell-to-cell and cell-to-matrix interactions. This protein has been shown to function as a potent inhibitor of tumor growth and angiogenesis. Studies of the mouse counterpart suggest that this protein may modulate the cell surface properties of mesenchymal cells and be involved in cell adhesion and migration. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for THBS2 Gene

Forensic Context

A study in mice and humans identified the THBS2 as a significant factor influencing hypertrophic scar formation and progression via downstream TGF-β1/P-Smad2/3 pathway activation, where it was identified as one of three key genes specific to hypertrophic scar fibroblasts [Cheng et al. DOI:10.1093/burnst/tkae043]. In a rat model of spinal cord injury, the gene encoding the THBS2 was found to be up-regulated at 1 day post-lesion in both rostral and caudal spinal cord segments [Bighinati et al. DOI:10.3390/ijms22041744].