Basic Information

Symbol
THRB
RNA class
mRNA
Alias
Thyroid Hormone Receptor Beta C-ErbA-Beta C-ErbA-2 NR1A2 THR1 Nuclear Receptor Subfamily 1 Group A Member 2 THRbeta1 Thrbeta2 THRbeta TRbeta1 TRbeta THRB1 THRB2 ERBA2 GRTH TRb Thyroid Hormone Receptor, Beta (Erythroblastic Leukemia Viral (V-Erb-A) Oncogene Homolog 2, Avian) Oncogene ERBA2 ERBA-BETA PRTH Thyroid Hormone Receptor, Beta (Avian Erythroblastic Leukemia Viral (V-Erb-A) Oncogene Homolog 2) Avian Erythroblastic Leukemia Viral (V-Erb-A) Oncogene Homolog 2 Generalized Resistance To Thyroid Hormone Pituitary Resistance To Thyroid Hormone Thyroid Hormone Receptor Beta 1 Thyroid Hormone Receptor, Beta
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis

MANE select

Transcript ID
NM_001354712.2
Sequence length
7576.0 nt
GC content
0.4326

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2138.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2286.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2057.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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Summary

The protein encoded by this gene is a nuclear hormone receptor for triiodothyronine. It is one of the several receptors for thyroid hormone, and has been shown to mediate the biological activities of thyroid hormone. Knockout studies in mice suggest that the different receptors, while having certain extent of redundancy, may mediate different functions of thyroid hormone. Mutations in this gene are known to be a cause of generalized thyroid hormone resistance (GTHR), a syndrome characterized by goiter and high levels of circulating thyroid hormone (T3-T4), with normal or slightly elevated thyroid stimulating hormone (TSH). Several alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human sepsis patients identified the THRB as a protein-coding gene located in quadrant 5 of a nine-quadrant analysis, indicating that both its co-expressed mRNA and corresponding protein were not differentially expressed between the sepsis group and normal controls [Wang et al. DOI:10.2147/IDR.S380137].