Basic Information

Symbol
THSD7B
RNA class
mRNA
Alias
Thrombospondin Type 1 Domain Containing 7B KIAA1679 Thrombospondin Type-1 Domain-Containing Protein 7B Thrombospondin, Type I, Domain Containing 7B
Location (GRCh38)
2:136765545-137677718
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001316349.2
Sequence length
6112.0 nt
GC content
0.4720

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1964.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2084.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1586.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001316349.2 NCBI
AGUGCUGAGGAGCCAGAGUCGCCGCCGGGUUGCCAGACGCUGGAAUGGG… 6112 nt 0.4720
Summary

Predicted to be involved in actin cytoskeleton organization. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the THSD7B as a shared upregulated differentially expressed gene between affected animals and adult human patients with hypertrophic cardiomyopathy, establishing its association with this cardiac disease in this non-human primate model [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].