Basic Information

Symbol
TLK1
RNA class
mRNA
Alias
Tousled Like Kinase 1 KIAA0137 PKU-BETA Serine/Threonine-Protein Kinase Tousled-Like 1 Tousled-Like Kinase 1 EC 2.7.11.1 Serine Threonine Protein Kinase SNARE Protein Kinase SNAK EC 2.7.11 PKU-Beta
Location (GRCh38)
2:170990823-171231314
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012290.5
Sequence length
5723.0 nt
GC content
0.4014

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1475.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1589.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1444.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001136554.2 NCBI
ACACUGAGGAAUGCCAAGGACUGCCAGCAGCACCAGAAGCUAGGAGAGA… 5268 nt 0.3679
NM_001136555.2 NCBI
AUUACAAGCACUUUCAAAAUGCCAACAUUUCCAGAAUAAAUUAUCUGAA… 5060 nt 0.3603
NM_012290.5 NCBI
GCAGAGGUUACCCCACCGCCUCAGCCGCCACCCACAGCCCGCCGCCGCC… 5723 nt 0.4014
Summary

The protein encoded by this gene is a serine/threonine kinase that may be involved in the regulation of chromatin assembly. The encoded protein is only active when it is phosphorylated, and this phosphorylation is cell cycle-dependent, with the maximal activity of this protein coming during S phase. The catalytic activity of this protein is diminished by DNA damage and by blockage of DNA replication. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]

Forensic Context

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