Basic Information

Symbol
BFAR
RNA class
mRNA
Alias
Bifunctional Apoptosis Regulator RNF47 BAR RING Finger Protein 47 Bifunctional Apoptosis Inhibitor EC 2.3.2.27
Location (GRCh38)
16:14632830-14669237
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016561.3
Sequence length
2903.0 nt
GC content
0.4678

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-923.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -977.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 765.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330500.2 NCBI
CUCUUCCUCUGCUCCCGCGGGGUCUGUGCUGAGAAUAAUGGCCCGGUUG… 2528 nt 0.4648
NM_016561.3 NCBI
CUCUUCCUCUGCUCCCGCGGGGUCUGUGCUGAGAAUAAUGGCCCGGUUG… 2903 nt 0.4678
Summary

Enables caspase binding activity; protein-macromolecule adaptor activity; and ubiquitin protein ligase activity. Involved in negative regulation of IRE1-mediated unfolded protein response; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; and protein ubiquitination. Acts upstream of or within negative regulation of apoptotic process. Located in endoplasmic reticulum and membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human prostate tissues demonstrated that the BFAR gene, an anti-apoptotic factor, was significantly upregulated in a time-dependent manner during the postmortem interval, showing up-regulation in all sample groups compared to a 24-hour control [Tolbert et al. DOI:10.1016/j.gene.2018.06.090]. This research, utilizing PCR array analysis on cadaveric samples, validated that mRNA transcripts, including the BFAR, remain detectable and show measurable expression changes up to 120 hours after death, providing gene expression profiles relevant for time of death estimation.