Basic Information

Symbol
TLR9
RNA class
mRNA
Alias
Toll Like Receptor 9 Toll-Like Receptor 9 CD289 CD289 Antigen
Location (GRCh38)
3:52221080-52225645
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017442.4
Sequence length
3352.0 nt
GC content
0.6229

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1324.31 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1377.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 850.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_017442.4 NCBI
AUUCUCUGAGCCGCUGCUGCCCCUGUGGGAAGGGACCUCGAGUGUGAAG… 3352 nt 0.6229
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the Toll-like receptor (TLR) family, which plays a fundamental role in pathogen recognition and activation of innate immunity. TLRs are highly conserved from Drosophila to humans and share structural and functional similarities. They recognize pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) that are expressed on infectious agents, and mediate the production of cytokines necessary for the development of effective immunity. Studies in mice and human indicate that this receptor mediates cellular response to unmethylated CpG dinucleotides in bacterial DNA to mount an innate immune response. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.