Basic Information

Symbol
TMCC2
RNA class
mRNA
Alias
Transmembrane And Coiled-Coil Domain Family 2 HUCEP11 Transmembrane And Coiled-Coil Domains Protein 2 Cerebral Protein 11 FLJ38497 Transmembrane And Coiled-Coil Domains 2 KIAA0481
Location (GRCh38)
1:205227912-205285632
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014858.4
Sequence length
3968.0 nt
GC content
0.6174

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1720.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1785.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 947.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001242925.2 NCBI
ACCAUUUAUGCCUCUGUCUUUCAGCUCCGUGUCAGGUCUCUGUGUUUGU… 3340 nt 0.5937
NM_001297611.2 NCBI
UGAACCAUUUGCAAGCCUAGCCUCCACUGGGGAGAAGUCUGUUCUCAGA… 2798 nt 0.5868
NM_001297613.2 NCBI
AGUGGGUGCAGAAUCCAUGUCUUUCUGAACGACAGUUCUGCUGUGAGAA… 2817 nt 0.5871
NM_001331034.1 NCBI
GUCUGGAGAUGGCGGCUGCAGAGUCUGGGAACUCAGGCACACCUGCUCG… 2772 nt 0.5952
NM_001375651.1 NCBI
AGUUCAAGUUGCAUACAUGCUGAGCCAGCAGCUAGAACCAGAAGCCGAA… 3597 nt 0.5891
NM_001375652.1 NCBI
AGUUCAAGUUGCAUACAUGCUGAGCCAGCAGCUAGAACCAGAAGCCGAA… 3786 nt 0.5848
NM_014858.4 NCBI
GCGCGCUCGCCGCGGGCUCGGGCCGCGGUCGCGGCUUUGCGGCAGGCUG… 3968 nt 0.6174
Summary

Involved in amyloid precursor protein metabolic process. Located in endoplasmic reticulum. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.