Basic Information

Symbol
TMCC3
RNA class
mRNA
Alias
Transmembrane And Coiled-Coil Domain Family 3 KIAA1145 Transmembrane And Coiled-Coil Domain Protein 3 Transmembrane And Coiled-Coil Domains 3 Transmembrane And Coiled-Coil Domains Protein 3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation

MANE select

Transcript ID
NM_020698.4
Sequence length
5874.0 nt
GC content
0.4471

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1753.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1860.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1471.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.......(((..((.((((((((((....(((((.(((((((...(((....))))))).).)).)))))...)))))))))).))..))).....(((...((((((((((((..(((((.(((((((..........))))).)).)))))..)))).))....(((..((((((((((......)))).....))))))....)))((((...))))........((((((((((((..........((((..(((.....)))..)))).((((((..((((.((((...)))).)))).....))))))........((((.....(((((((........)))...))))......))))........(((((...((((....))))..((((((((((.((.((((..(((.(((.....)))......(((((.(((((((.((....(((..((.(((((.........))))).))..))).)))))..))))..)))))...........((((.............))))...((((.((((((.(.((((((((.((((.(.((...(((....)))...)).).)))).))).....((((..((...))..)))).....((((.(((((...((((((....((((.((.....))))))...))))).)...))))).))))...)))))..).)))))).))))....))).)))).....((((((.((...........)).)))))))).))).))))))))))))......((((((((...))))))))(((((...(((....)))..))))).))))))))).)))......))))))...))).(((..(((((((..((((((.....(((((((..(((.(((...))))))...(((((.......))))).((((((((.(((((.(((.(((..((..((((.(((......))).)).(((....)))..(((.(((((...((((((....((((..(((((((((((((...((((((((...)))))...(((((((((((((.(((((........)))))((((((((((((((((.(((((....(((.((((....)))).)))...)))))((((((((((.((((..((.......))..)))).))))).((((((((.(.((.(((((((...(((((...)))))..((((..((.((((((..((((((....)))))).)))))).)).)))).........(((((.......))))).(((((.....)))))(((..((.......))..))).....))))))).))((((((((......((..((((((((((.((.(((((.((((((...((((((.(((((.((((......(((........)))(((((((((((((((......)))))...........))))))))))((((........))))......((((((......((.((.((..(((((((.((.........(((..(((((.((((((.((((((((((((((((.((((....)))).)))))).(((..((((((((..((((.....(((((.....)))))(((((.((((((....(((..((.(((((((.(((((...(((..((((...............))))..)))))).)).))))))).))..)))....)))))).)))))....((((...........))))...((((...........((((((((.(((((((.......))).)))).....(((........)))(((((((((..((((.(((..((.((((.(((((.((........))))))).))....)).))..))))))))))))).))).....((((((.(((((..........))))).)))).))..))))))))..........))))))))(((((((...)))))))((((((((((((((..(.((..((...))..)).)....))))))))))))))..)).))))))..))).(((((.((((...(((......))).))))...))))).......(((((.((((((..........((((.((.(.(((((((.((((((..((((.(((((.((....(((...(((((..(((.......)))..))))))))..(((((((...((((((((((((((((..(((........)))..(((((((((((((((((((....((((((((...((((......))))...........))))))))))))....)))).)))))))))))((((......))))..............)))))))))))....((........))))))).)))))))....((((((...))))))..))))))).....(((....(((((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))))...))).....)))).))))))))))))).).)).))))((((.((((.....)))).)))).......)))))).)))))((((((((((......((((...............))).)......))))))))))...)))))))).))...))))))...((((.....((((.(((..((((....))))..))))))).....))))....((((...(((((((.(((((...((.(((((((((...(((((.((((((.((((.(((((...(((.(((..((((((.(....).))))))......................((.(((((.(((((...((((....))))....))))).....))))).))....(((((((....)))))))........))))))((((((.............)))))).((((((.....))))))............)))))..)))).))).))))))))...)))))...(((((.(((.....))).)))))..(((((.(((((.(((..((((...(((((..((((((((.(((((.(((((((.(((..(....)..))).)))(.((((..((.(((((.(((((((.(((((((...((((....)))).............(((((....))))).....((((....))))...))))))).)))))))((((((..(((...(((((((..((...))..)))))))..))).)))))).)))))..))..)))).)))).).)))))..)))..((((((...(((((........))))).....))))))))))))))))..))))..))))))))...)))))....((.(((...((((((.....(((((.(((..(((......((((...)))).....))).))).)))))..))))))...)))..)))))).))....))))).))))))).)))).)))))))))))))))))..)).)).))......))))))..)))).))..))).))))))(((....)))...))))))))))).)).))))))))))..))(((((((((((((.((......)).)))))))))..)))).))))))))).))))))))....(((.........)))...((((((((((....))))))).)))((((((...)))))).....((((((..(((((((....))))))).)))))).)))))..)))))))).((((...((((((((......(((((.(((((.(((((((.((((.((((((.(((....)))........((((...((((.(((((((((((......)))((.((((.............)))).)).)).)))))).)))).))))......(((((......)))))))))))))))......(((((...(((((((................)))))))..))))).)))))))))))).))))).....)))))))).))))...(((((..(((((...)))))...)))))..(((.((((((((.........))))))..))...)))..(((((((((.................(((((...........)))))..................((.((((.....))))))..(((.........))).((((((((((((((.((........)).)).)))))))))))).......)))))))))........))).)))))..)))))))))))))((((((((((.......))))))))))........(((((.....(((((......))))).....)))))..........((((.(((((((..(((((.((..(((((((....)))))))..)).)))))..(((((((.....................)))))))........((..((((((((..((((((..(((((((((((((((.......)))))..((((.(((((...((((....)))))))))))))((((((........))))))..((((....((((((..((((.((.....((((.((((((........))))))))))......)).)))).....))))))....)))).............................((((....)))).......)))))....)))))))))))..))))))))..))((((((.(((((....))))).)))))).((..(((.((((((((....)).)))).)).)))..))))))))))))).((((.....)))).....))).))))......)))))))))..))))..))))))))))).)))....))..))..))))))...)))))..))))))))))))))).....))))))....)))))))..))).(((..(((((((((...(((.(((..(((((((((((...(((((((((((((.......)))).....((((((((((((((((.(((((((.((((.((.....)).))))..)))....))))..)))).))))..))))).)))((((((((((.((((((((((....)))..)))))))......(((((((..((((.(((...((..(((((((........(((((.....((((.((((((((((((((((((((((((((..............)))).))))))....))))))).))))).))))..))))....))))).)))))))..))...))).))))..)))))))........))))))))))((((((.......)))))).((((............))))..............................))))))))).))))).........(((((..........))))).....((((((((....((((((((...))))))))..)))))))).................(((((((.....((((((.((....)).)))))).........))))))).))))))..))).)))...)))))))))...))).))))((((((((((((((....(.((((((((((((....(((((((((((.((.(((..(.(((((.............)).))))..))).)).))))))..)))))..))))))..(((((((....)).)))))...((((((((((((...((((((....)))))).))))).......))))))).....)))))).)..))).)))))...)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((({{{{{{{,.((.((((((((((....{((((.(((((((...(((....))))))).}.)).)))))...)))))))))).))(((((.....(((...((((((((((((..(((((.(((((((,.......}.))))).)).)))))..)))).}}...,(,({{((((((({((......)})),....))))))},},.,,((({...}))}........((((((((((((..........((((..(((.....)))..)))).,{{{{{,.(({(,((((,,,||||,||||,|,..,}}}}|........((((.....((((,,(,.......))),..))))......))))........|{{((...{{((.,..}}}},.,{((((((({.((.{(((..,,{.|,{{||{{||||{....(((((.(((((((.((....(((..((.(((((.........))))).))..))).)))))..))))..)))))........,..(({{....,,......,||||..{(((,{(,({{,...|,||,,||}|,,|}|}|,...(((....)))..,||,|.||||.|||,....,|||.,|||,.,...}|||{{,..((({.,{{{|,..{((({(.,,,(,{{,||,.,.,)))}},...))))),..,,))))),),}}...}))},.})})))),),))})...,})),))),,,...|||||{.{{..,,,,,....}}.}}|||}}},))).}}}}}))})}}}.,,...,(((((((...)))))))|(((((...(((....)))..)))))}))))))))).))).....}))))))...))){(((((((({((((.(((((((.,,(((((((((((.((.(((.((..((((((...{((..((((,,(((((..(((((((((((((((...((((....))))(((......)))((((,,(((((({{.(({(((,..,((..{|||.{||...((({(((((({{{,....||,..(((((...})))).({{,..(((((({((......)))))))),}}}(((.....))).......(((((..,.(((.((((....)))).))).,.)))))..{..(((((.((((..((.,....,))..)))).)))))..)})))))))..}}}},,,..,{|(((({...))))).,)||{..}|}|||||,.,|||{{|,..,)))))}.)))),)}))..))))........))))}.})))))))))).(((((.....))))).))))).||{{,{((,.((((.....{((((,..})))),,))))..})))).},))))..)))...))))))..)).))).)))))).))))..))).},.))))))))))).......(((((((((((((((......)))))...........)))))))))).})))))))}}.,,.....)))))........||||,}}}),,,|,,,{{{((((.{(((((.((((((((((((.((((((........,{(((((.{(((....)))}.)))))}.,,,.(((((((.,,,........,(((((.....)))))(((((.((((((....(((..((.(((((((.(((((,..({(..((((...............))))..)))))),}).))))))).))..)))....)))))).)))))....((((...........)))).,{(((((({.,,.,{{,.{(((((((((......(((((((({{{.((....}).|,}}.....((((((((.........((....))........))))))))........,.{{{{.{((((({{,{((.........))),,.(((((((,....((((,(({((((.((((...(((((((,,({..(((((((((((....((((((.,.((((((((((.........((((((((((((((..(.((..{,...,}..)).}....)))))))))))))){(.((((((..(((((((((((.((((...(((,....,))).))))...)))),.......(((((.((((((..........((((.((.(.(((({(((((((((..{{{,.(((({,((,...(((...(((((..(((.......)))..))))))))..(((((((...(((((.{(((((((({,,(((..,.....)}},||((((((((((((((((((....((((((((...,,,,......||},...........)))))))))))),...)))).))))))))))|{(((......)))},.............})))))))))}....||........))))))).)))))))....{(((({...}))))),.}}))))}.....(((....(((((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))))...))).....,})}.))))))))))))).).)).))))((((.((((.....)))).)))).......)))))).))))){{((((((({......{{((.....,,........}}},},}....))))))))}}.((((...))))...((({{(....(((((....{{......)},}})))))})))).,))))))..))))))})..,.(((((({.{(((.(((((.((..(.(((..(({..,((((((((....(((.((((((..((((((.((..{{{.,..|}|((((((((((((..((.((({(..{{{...,...((((((((((((((((,{(((,,,,,}}}((((({{{({(({,(({{(.{{....||{{|||,,,.))))))}}}|..,.{{{{{{,((((((({,.....,,...,)))}}.((((((.....))))))..(((((((.((((((.((((((({({{{,..........,,,,)}}|||||,(((.....))).}))||.||||((..{{{{.((({{,((.....,||}.}})))...}}}),}...,,,,....,}}}}}|,,...)))..))))))..)))))))...,(((((((,(((({((,..{{{|,,..))))}}...........(((((....))))).....{{{(,,,.}|||,..,}))))},))))},.{(((((..{{,,,{(((((((..((...))..)))))),,,))}.)))))).,,...,||||}|||.}|}|,,},}))))|,|)))}||{{{{...(((((........))))).....}}}|||((({.{{({.....{{{{{{{.||,,..,..........{((((((((((((......,..............{(((((((((((((((.,{{..{(({(,....{,,....(((((({.{{,.}}|,},},.}||,{|,|||||,{{|||{|||||,,{{{{((((({,,((,(({.(((((......|||}}..,|||.}}}.{{{....}}}{({....}}},,,,,)||||||||,{{.{||((((((((((((((({((((((((.((......}).))))))))}..))))))))},,..{{||,||,.|,....,,......,,})),)))}|||{{((({....))))))).}}(((((((...)))))))....((((((..(((((((....))))))).)))))).,,}.|||,|||.{{{{{{,},,,((((((((......(((((.(((((.(((((((.((((.((((((.(((....))).....,{,{(((...((((.(((((((((((......)))((.((((.............)))).)).)).)))))).)))).)))}..,,..(((((......)))))))))))))))......(((((...(((((((.....,.......,..)))))))..))))).)))))))))))).))))).....)))))))).{({{...(((((..(((((...)))))...)))))}}}}....((((((.........))))))..|||,,}}}},,|||,,(((,,....,,,,..,,,,,{((((...........))))}.......,|,,..,,)}}))},|||.}},.,,})))})||,.........|||,((((((((((((((.((........)).))))))))))))))}},.....}}||||}},.,,||{{{{{{|||||{{((({{(,,....,||||||||||,,,,,...)))))))))})},,}},},},}}))))),}))))))))))}{{{..(((((((.,{,...,},.)))))))..)}}........,)))))))))))))...,,,.,,.)))))))...||||,||,},.,..{{{({{{....{{.,||||||...(((((((((....)))|,,)))),...|||||||..|||}||}..,|.{||,,,,))}}}{(((({...{{{|.,}})))))))}}}})|||||||},}}..}}))),)),.{(((,...((((((..{,(({((.....{((({,((((({{,,....,))}))))))}}}}}.,,.,,,)}}},.))))))..,,))},...{{{{..{{{.................((((....)))).......{{((({....,,..,,,,))}}))))))))}.,.{{((((.(((((....))))).))))}|{{(|.(((,({((((((....))},))).}}.)))..}},))))}}||...{{{((,...}))),|,......)))))))))))|((((.....)))),.....,,.,.)).))))))..)))))).))))))))))))))..))).))).))))))))))))))).,}}.)))))))))).,.)))))))))))).))))).,,,.,,....)))))))..))))..))))))))))).......,((((,,.....,,.))))|(((({..........})))),..{((((({.....}.)))))),{{{{{......}}}}}}((((((((((.((,..,,.(((((((,...,))}))))}))).))))))))))........,||.((((((,....,)))))).,))))))))....,{{{{......}))))))))))))))))))))))))))))))),....|{(,((.{{,....,...}}}},....,,}}}.)))}},}}}}))},))...))))))).)))))).)),})))))...{{(({......(((((..((((..((((((((......((((............))))............((((((((((.{(((((.....)))))|{((({{,.|||,.,{{{,,..,,,.,,,,|,|||,....{{{{{{{{..,,||||||||,,,))}}}}}}..}}}}||||..,{{{{{.....}}}}|(({(({,,..,((((((.((....)).)))))}.......,,|||||}|{{,,{{|{,|}}},}})))}}))|||||{,.},|||||,,,{((({(,(((({(((({{,,,.,{,{{{,,....))}))},})}}}))))))..})))).)))))}.))))))))))))))...))))....))))..)))))}))}}.....)))).)))))),))),.,{{..{{{{{{({((((...((((((....}))))}.))))},......})))))),,))}..,.||{{||.....})))}....,,}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCAGAUUCAAAUGCCUCGGGCAGGAGGGUGAGCUAGCUGCCGAUCCUGC… 5748 nt 0.4386
AGAGGCAACAGCUGCAGCAGCCGCGCCGCCCCCUCGCCCGCGGCUCCCA… 5874 nt 0.4471
Summary

Enables 14-3-3 protein binding activity and identical protein binding activity. Located in endoplasmic reticulum. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the TMCC3 as one of 81 candidate mRNA markers for predicting the time-of-day of bloodstain deposition from whole transcriptome sequencing [Gosch et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102915].