Basic Information

Symbol
TMED8
RNA class
mRNA
Alias
Transmembrane P24 Trafficking Protein Family Member 8 FAM15B Transmembrane Emp24 Protein Transport Domain Containing 8 Family With Sequence Similarity 15, Member B Transmembrane Emp24 Domain Containing 8 Protein TMED8
Location (GRCh38)
14:77335029-77377097
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_213601.3
Sequence length
7761.0 nt
GC content
0.4301

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2335.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2488.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1947.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001346131.2 NCBI
ACUCGCGGCUGGCAGCGGAGAGCUCCGUGCGCGGGCUGCAGAUGUCUGA… 7776 nt 0.4302
NM_001346133.2 NCBI
ACUCGCGGCUGGCAGCGGAGAGCUCCGUGCGCGGGCUGCAGAUGUCUGA… 7763 nt 0.4301
NM_001346134.1 NCBI
GAGAGAGAGACGGGAGGAGGUCCCAGACUCUUUUAAACAACCAUAUCUC… 7829 nt 0.4242
NM_213601.3 NCBI
ACUCGCGGCUGGCAGCGGAGAGCUCCGUGCGCGGGCUGCAGAUGUCUGA… 7761 nt 0.4301
Summary

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Forensic Context

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