Basic Information

Symbol
TMED9
RNA class
mRNA
Alias
Transmembrane P24 Trafficking Protein 9 P24alpha2 HSGP25L2G P24a2 Transmembrane Emp24 Protein Transport Domain Containing 9 Transmembrane Emp24 Domain-Containing Protein 9 P24 Family Protein Alpha-2 Glycoprotein 25L2 GMP25 P25 GP25L2
Location (GRCh38)
5:177592195-177597242
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017510.6
Sequence length
2546.0 nt
GC content
0.5448

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1005.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1050.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 703.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_017510.6 NCBI
AGGUGGAGCAAGAUGGCUGUGGAGCUGGGCGUGCUGCUCGUCCGGCCCC… 2546 nt 0.5448
Summary

This gene is a member of a family of genes encoding transport proteins located in the endoplasmic reticulum and the Golgi. A similar gene in mouse is the target of microRNA miR-296, which is part of an imprinted cluster. [provided by RefSeq, Jul 2016]

Forensic Context

A study in human patients with sepsis demonstrated that the TMED9 exhibited increased polyadenylation in whole blood samples from individuals with viral infection compared to those with bacterial infection [He et al. DOI:10.1186/s12879-025-11078-z].