Basic Information

Symbol
TMEM165
RNA class
mRNA
Alias
Transmembrane Protein 165 TPARL SLC64A1 TMPT27 GDT1 Putative Divalent Cation/Proton Antiporter TMEM165 Transmembrane Protein TPARL Transmembrane Protein PT27 TPA Regulated Locus CDG2K FT27
Location (GRCh38)
4:55395652-55453397
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018475.5
Sequence length
1931.0 nt
GC content
0.4500

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-628.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -664.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 443.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018475.5 NCBI
GACUCCAGUUUAGCCGCCGCCGGAGAGGACGGGCGCCGAGCCGGGGCUG… 1931 nt 0.4500
Summary

This gene encodes a predicted transmembrane protein with a perinuclear Golgi-like distribution in fibroblasts. Mutations in this gene are associated with the autosomal recessive disorder congenital disorder of glycosylation, type IIk. Knockdown of this gene's expression causes decreased sialylation in HEK cells and suggests this gene plays a role in terminal Golgi glycosylation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.