Basic Information

Symbol
TMEM170B
RNA class
mRNA
Alias
Transmembrane Protein 170B
Location (GRCh38)
6:11537748-11583524
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001100829.3
Sequence length
8891.0 nt
GC content
0.3732

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2437.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2602.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2399.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001100829.3 NCBI
CCUCGAGUGUCGGCGACCCGAGGGCGGGCAGGCGGGCGGCAGGUGCCGC… 8891 nt 0.3732
Summary

Involved in negative regulation of canonical Wnt signaling pathway. Located in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the TMEM170B as a significantly increased mRNA in sepsis patients compared to controls, and it was regulated by most differentially expressed miRNAs and enriched in the T cell receptor signaling pathway and influenza A pathway [Qin et al. DOI:10.1097/JCMA.0000000000000209].