Basic Information

Symbol
ACHE
RNA class
mRNA
Alias
Acetylcholinesterase (Yt Blood Group) Acetylcholinesterase (Cartwright Blood Group) Acetylcholinesterase Yt Blood Group EC 3.1.1.7 YT Apoptosis-Related Acetylcholinesterase EC 3.1.1 ARACHE N-ACHE ACEE AChE
Location (GRCh38)
7:100889994-100897022
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000665.5
Sequence length
2172.0 nt
GC content
0.6575

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1021.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1057.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 599.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000665.5 NCBI
GUCAGAGUCGGCUCAGCCUGCGCCGGGGAACAUCGGCCGCCUCCAGCUC… 2172 nt 0.6575
NM_001282449.2 NCBI
GUCAGAGUCGGCUCAGCCUGCGCCGGGGAACAUCGGCCGCCUCCAGCUC… 1908 nt 0.6593
NM_001302621.3 NCBI
GUCAGAGUCGGCUCAGCCUGCGCCGGGGAACAUCGGCCGCCUCCAGCUC… 2928 nt 0.6486
NM_001302622.2 NCBI
ACUCCGCCGCUGCAGGUCUUUGGGUCGCGUCUGUCACUGCGCUCUGUCG… 2156 nt 0.6517
NM_001367915.1 NCBI
GUCAGAGUCGGCUCAGCCUGCGCCGGGGAACAUCGGCCGCCUCCAGCUC… 2175 nt 0.6575
NM_001367917.1 NCBI
GGCCUGUUCGUGGACUGAGGCUUCUGGUGCCCUCACUGCACGAGCUGGG… 2159 nt 0.6522
NM_001367918.1 NCBI
ACGCACGCCCGACGCUGGCCUGCGCCGGCCGCUCUCCCACGCGGGGUCU… 2530 nt 0.6632
NM_001367919.2 NCBI
ACGCACGCCCGACGCUGGCCUGCGCCGGCCGCUCUCCCACGCGGGGUCU… 2527 nt 0.6632
Summary

Acetylcholinesterase hydrolyzes the neurotransmitter, acetylcholine at neuromuscular junctions and brain cholinergic synapses, and thus terminates signal transmission. It is also found on the red blood cell membranes, where it constitutes the Yt blood group antigen. Acetylcholinesterase exists in multiple molecular forms which possess similar catalytic properties, but differ in their oligomeric assembly and mode of cell attachment to the cell surface. It is encoded by the single ACHE gene, and the structural diversity in the gene products arises from alternative mRNA splicing, and post-translational associations of catalytic and structural subunits. The major form of acetylcholinesterase found in brain, muscle and other tissues is the hydrophilic species, which forms disulfide-linked oligomers with collagenous, or lipid-containing structural subunits. The other, alternatively spliced form, expressed primarily in the erythroid tissues, differs at the C-terminal end, and contains a cleavable hydrophobic peptide with a GPI-anchor site. It associates with the membranes through the phosphoinositide (PI) moieties added post-translationally. AChE activity may constitute a sensitive biomarker of RBC ageing in vivo, and thus, may be of aid in understanding the effects of transfusion[provided by RefSeq, Sep 2019]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.