Basic Information

Symbol
TMEM41B
RNA class
mRNA
Alias
Transmembrane Protein 41B KIAA0033 Protein Stasimon Stasimon
Location (GRCh38)
11:9280654-9314636
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015012.4
Sequence length
3798.0 nt
GC content
0.3828

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1043.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1120.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 960.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((((((((((((.(((.(((((.(((((((((.((((....(((((...(((((((((((........((((((.....(((((((....)))))))..((((((((..((...))..))))))))...))))))))).))))))))....((..(((.((((.(((.......))).))))))).))(((((..(((((((((((..(((((((.(((((.((((((((((((.((.....)).)).)))))).))...((((....)))).((((((((((((((((((((.....((.((((..((((((.(((.........(((((((((((.........(((((((((((......(((((.(((......))).))))).((((((((((((((((((((.((((...(((......)))...)))).))))........(((........)))...)))))))))))(((((..((((((.......))))))..)))))....((((....))))........)))))...((((.(((((((((.....(.(((((((.((((((..((((.....((((.(((..(((((((.((((((((..(((((....(((((((((((((((((((((......)))))))......)))))........)))))))))..((((...(((((....(((((.(.((.(((((..((((...))))..................((((((((((.((((............)))))))))..(((((((.....)))))))...((((((.(((((.....))))).))))))..(((((((...(((..(((((.((.((((((........((((........))))......)))))).)).)))))..)).)...)))))))))))).........))))).))..).)))))....)))))))))((((............((((((((((((((....(((..........)))))))..))))))))))))))....))))))).))))))....(((((.((...((((.....)))))))))))................((((((((........))).)))))..)))))))...))).))))......))))..)))))).))))))).).............))))))))).)))).((((((((.........))))).))).....................))))))))))).)))))))))))))).)))))))).))))..)))))))))))))).....(((((((...))))))).......((((.(((((.(((...((((...(((........)))...))))...)))))))).)))).........((((((((((((((((((((.(((..((((((...(((((((((...............)))))))))...))))))..))).)))))))))).))))))))))))))))(((((((.(((((((((((((.(.(.....).))))))))..))))))...)))))))....))..))))))))))))..)))))....((((((((......(((....)))......))))))))......((.((((...)))).))))))))......))))).)))))...))).).))))))))).))).)).)))......)))))))))(((((......)))))...((((((((......))))))))............((((....))))...((((((((((((((((.((((((((((((((.((((..((((.......))))..)))).))))))..(((((((((((((((((((((((..((((((((....))).)))))((((((((..((...(((((.((((((((((((....(((((.(((((.....((((((......))))))....))))).)))))............((((((....)))))).........................((((..(((((...(((((((..((.(((((((..((((((.(.......).))))))..))))))))))))))))...)))))..))))...((((((..(....)..))))))...(((((((...(((.((((..(..(((((...........))))).)..)))))))..)))).))).)))).))))))))..)))))...))..))))))))...((((.(((...........((.((((((..(((((((....)))..))))))))))))((((((((..(.(((((..((((...)))).))))).)..))))))))....)))))))..))))))))))........(((((((.(((....((((..((((((................(((.((((.....(((((((((((..(((((....((((((((((((((.(((..............))).))))))))..))))))..........(((((((((.............)))))))))...(((((..((.(((.((.((....)).)).))).))....))))))))))..))))))))))).)))).)))....))))))))))..))).)))...))))...))))))))))))).......(((((((....((((((....(((((((((.......((((((((((((...((((((((((.((((...)))).....((((.......))))....((((((....((....)))))))))))))).......(((((((....)))))))..)))).)))))))))))).((.((((((((..((((((.........))))))((((((((((((((.((...(.(((.......))).).)).))).)))))))....((((((...((....)).))))))((((.((((....)))).))))(((((..((.(((....))).)).))))).))))(((((..(((..(((((........)))))..)))))))).......)))))))).))))))).))))...))))))....)))))))................))))).)))))))))))))))))))....((((....))))...........(((((((((((((.........)))))))....((((((..(((.(((...))).)))..))))))......))))))))))).))((((((.((((((............))))))))))))......((((((((((...........................)))))))))))))))....(((((((((((...((((((((((....))))...(((((((......((....))......))))))).)))))).))))).((((...))))...((((..((((.(.((((.(.(((((((..(((((((((.....(((.....)))..))))))))).(((....)))((((((....)))))).))))))).)))))...).))))))))..((((((((..(((((((..(((((((((((((((..........)))))))))))...)))).))).))))))).))))).((((.(((((((((((......(((.(((((........)))))..)))......))))..))))))).)))).)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.(((((((((((((({(((.(((((.(((((((((,((((....(((({...((({{{{((({.,|||.,.{{{{{{.|||,(((((({....|}}}}}}..((((((((..((...))..))))))))...}}}|}}}}}.)))}})))....{{..(((.((((.(((.......))).))))))).}}{((((,.((((({(((((..(((((((.(((({.((({((((((((.((.....)).)).)))))).}}...((((....)))).((((((((((((((((((((.....{{.{(((,,((((((.(({........,(((((((((((.........,((((((((((,,,...(((((.(((......))).))))).{{{,((((((((((((((((.{({{.,.(((,,,,..|}}...}}}}.))}...,,.,,,|||,.......))).)))))))))))))|((((..((((((.......))))))..)))),....((({....}))),,,,...(((.((...((((.(((((((((,,...{.(((((((.((((((..((((.....,((({((({{((({(((.{(((((({.,((,((,.{.(((((((((..((,(((((((......))))))).},...||||....,},}.))))))))).}))}.}}|.,((((.((((({(({((,..{,,,,,((({,,.||||{..,.........,,...,|||||{{{,.{{{{,({,,,,,,.,.|||||}}},..(((((((.....)))))))...((((((.(((((,...,))))).))))))..,{{{(((,,.,{|,,||{{{.{{.{{{{||}},...,}||||,,,.....})))......}))))).)).}))))..)).}.,,)))))}}}}}},....,,,..}|||||,..{||{||,,,..........,.)))))}..........{(((((((({((((....(((.......,..)))))))..})))))))))))))).}}))}}}},,}})))}....(((((.{{...{{{{.....},}}}}))))).,,,,},,,.,}}))}||||||{{,.......,}},}}}||..,,})))).,,||}.,,,,...,,.))))..)))))).))))))).}.....,}},....))))))))).)))))).)))...,}},|{((((((....)))))}}.,..........,},.))))))))))),)))))))))))))).)))))))).))))..)))))))))))))).....(((((((...))))))).......{,{{,((({,{{{{...{{{{,{,{{{,{,,...,},,...})})}}}})}))))},}))},,,,,,,..((((((((((((((((((((.(((..((((((...((((((((,..............))))))))....}))))},..))}.)))))))))).))))))))))))))))(((((((.(((((((((((((.(.(.....).))))))))..})))))...)))))))...|)}..})))))))))))..))))).{,,((((((((......(((....)))......)))))))).,,...,,.{{,....,}}}})}))))))......))))).))))).,.}))},.))))))))).))).)).))}..,..,))))))))}(((((......)))))...((((((((......))))))))...,........((((....)))).,.((((((((((((((((.((((((((((((((.(((({{(({{,,,,.,,|||}..}}}),)))}},..{{{{{{{{{{{,{{{({,,.,,,..((((((((....))).)))))((((((((..{{...(((((.((((((((((({....,{(((.(((((.....((((((......))))))....))))).))))|..........,.((((((....)))))).}........,,,,......})}}.((((..(((((...(((((((..((.(((((((..((((((.{.......).))))))..))))))))))))))))...)))))..)))).,,((((((..{....},,||||||...((,((((...{{|,||||.}|},||||{........,,,}}}}}.),,)))))))..)))).,)}.))))}))))))))..)))))...}}..))))))))...((({.,{,.......,,..{{.{(((((..,{{{(((....)}}..}}}}))))))))|||||((({{{.((((,..,,,|}}},)))}))}}|||,.||,,,,,|,,..}}))))){{||||||||,.{({{......|,}))}.|}}}}}|||,,.,{{({{,,..,.,,,}},,,|,|{{.((({.....(((((((((((..(((((,,..((((((((((((((.(((..............))).))))))))..))))))..........(((((((((...,.........)))))))))...{{{{{..{,.(((.,{.{|....},.}}.))).}}.,,.)}})))))))..))))))))))).}))}.})),}}..}}}}}))}}}}}}}...........,,}}}}}}}}}}}}}}.,.....(((((((....((((((....(((((((((.......(((((((((((({,.{({{(({{{,.((((...)))).....,||{.,..,,.|||}...{((((({....{{....,,))))))),},)),.,,...{{(((((....))))))),,}))),)))))))))))).((.((((((((.{((((((,{.......))))})|||,((((((((((.((...{.(((.......))).}.)).))).)))))))....((((((...((....)).)))))),{{{.{(((....)))},}}},(((((..({.{{{....))}.)).))))).,...(((((..(((..(((((........)))))..)))))))).......}))))))).)))))))}})))...))))))....))))))).,,,,,..........))))).)))))))))))))))))))....{{{{....}}}}...,,},....(((((((({({{{.........}},}}}},...((((((..(((.(((...))).)))..))))))....}}))))))))))).)){{{{{,,{{{{{(,,{{{......,)))))}}}})))......((((((((((...........................)))))))))))))))....((((({(((({...{{{{||||{|,.,,))))},,(((((((......({....,,..,...))))))).,}}}}|,}}}}}.{(({...))}),..({((..{(({,|.{{{|{(.(((((((..(((((((((.....(((.....)))..))))))))).(((....))){(((((....)))))}.))))))).))}))...}.)))})))),.{(((((((..(((((((..(((((((((((((((..........)))))))))))...)))).})),))))))).))))}.{{{{,|||{{{{{,((,,,{..(((.(((((........))))}..)))......}}},.,})))}}),)))).})}}}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001165030.3 NCBI
GCAGUACUCGCUGGGCUGAGGUCGUCUCGGGUGAGGAGGUCGCGCCGGA… 683 nt 0.4451
NM_015012.4 NCBI
GCAGUACUCGCUGGGCUGAGGUCGUCUCGGGUGAGGAGGUCGCGCCGGA… 3798 nt 0.3828
Summary

Enables phospholipid scramblase activity. Involved in autophagosome assembly and intracellular lipid transport. Located in mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane contact site. Is active in endoplasmic reticulum membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in pigs (Sus scrofa) demonstrated that cold exposure induces epigenomic changes, where the TMEM41B was presented as an example gene showing H3K27ac signal distribution around its transcription start site in the investigated tissues [Yaping Guo et al. DOI:10.1016/j.jgg.2024.06.017].