Basic Information

Symbol
TMEM56
RNA class
mRNA
Alias
TLC Domain Containing 4 Transmembrane Protein 56 TMEM56 TLC Domain-Containing Protein 4 FLJ31842
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_152487.3
Sequence length
6805.0 nt
GC content
0.3490

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1651.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1794.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1898.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((((((((..((((.((((((.......)))))).))..))..))))))).)))))....))))((.(((((...((((((.(((((((...))).))))...((((.(((((.(.((.((.(.(((((((((...(((..(((((((((...((((.(((..((.((.((((....))))...)))).)))))))......)))).))))).))))))))))).).).))...)).)))))).)))).((((((......(((((.((((.((.........)).)).)).)))))))))))...((((((((((...(((((.((..((((.....(((..(((((((((............((((((.((((...(((((((((((((((.....)))).))))...(((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((.((..((((((...((((.........))))))))))..)).))))).)))))..)))))))..((((((.(.((((....(((((.((((.((.((((((......(((((........((((.((((....)))).)))))))))(((((((((............((((((....))))))...(((((((.((((.((..............))))))...))))))).(((((.........(((((.((((((((((((..(((((........))))))))......)))))))))))))))))))(((((....)))))...)))))))))(((((((((......).)))))))).(((.(((.(((..((......)).))).))).)))((((.(((((((((......))))........))))).))))(((((.......)))))....)))))).)).)))).)))))..)))).).)))))).....))))))))(((........)))...(((((((.(((((.(((....(((((..(((.((((...((((......(((((((..((((((.((((((((((((((((((((.(..((((((...((((((.(((..(((((....))))).))))))))).(((((((....(((((.(((.(................).))).)))))........((.((((((((((...))))))))))))..((((....))))(((....))).....((((((....)))))).)))))))((((((.((((..((((((((((((.((((.....))))((((...))))(((((.((((((((..................((((((((((...((((.....))))......)))))))))).(((((((((((((((((((..((((((..(((.((.(..((((..(((((((.((.........)))))))))))))..)))))).(((((((.....)))))))................((..(((((((((.......)))))))))..)).)))).))..)))))))))))((((..((((((((...(((((...((((......((((((((.(((((.(((((((.........(((((....(((((((((..((((((......(((......((((((((((.((((..........))))........(((((.((((((.........(((...((((.((((((((((....(((.((.((((((((((..(((..(((((...((.(..............)))...)))))..)))..))))))..)))).)).)))...)))).)))))).))))..)))......(((((.............))))).)))))).))))).(((....((((.((((((((..(((...))))))))))).))))...)))))))))))))......)))....)))))).)))))))))..)))))))))))).))))).))).))))).....)))))))))...........))))))))..))))........)).))))))..))))))))))))).........((((((((((((....((((((.............((((((..((...(((((((((((.......................))))))....(((.......)))........)))))...)).....))))))((((((.(((....))).))..))))......))))))...)))))))))))).....)))))))......)))))....))))..))))))..........(((((((........)))))))..................))))))....).))))))))).(((((((((.........)))))))))................)))))).))))).)))))).((((...........))))....))))))).......))))..)))).)))..)))))...))))))))................))))))).(((((((......)))))))......)))))))...............)))))))))...)))))))...))))))))))...((((......)))))))))))))..)))...))))..)))))))...((((((((((((......(((((....(((.((((.(((((.((.......)).))).)).)))).)))))))).....((((((.....))))))..((((((..............)))))).(((((.(((.(((((((...((((((.....((((((....))))))......))))))......))))))).))))))))..((((..((((((.(((((....))))).))))))......)))).........((((((...(((((...)))))....))))))...((((.(((((((((......(((((((((.....((.(((((...(((((((.(((((((....(((((((((((.((((((............))))))..(((((.(((((((........................((((.....))))..((((((....((..(((.((((.....)))).))).))...))))))....((((....))))))))))).)))))...........(((((((((((((((((((((((((....((((.((((((((((....))))..)))))).)))).....(((.....................)))....)))))))))))))).......((((((....))))))....((((((((((((...)))))))).))))........((((((............))))))..(((.(((((((((.......(((((((((.........((((..((((..(((((((.....((.......))....)))))))....))))..)))).........))).))))))........((((((((.(((((((((((...((.((.((((((......((((((((((((((............)))))).(((((.((((..((((((((((...))))))))))))))))).))................))))))))(((((((((((((.......))))))((((((.....)))))).............((((((.(((((((....(((........)))..)))))))))))))....((((((....))))))((((((((..((..........)).))))))))....)))))))..............((((((....).)))))......))))))..)).))...)))))))((((.((((...)))).))))(((((((((((....)))))))))))....((((((......)))))))))).)))))))).........((((((....)))))).((((((((((((((.((((........)))).))))))))))))))..))))))))).)))(((((((.((...((((.........(((((......))))).))))...)))))))))......((((((((.(((.........)))..))))))))...))))))))))).....((((((((((((((((((.((((((((((((.....(((.((((((((((((..(((((...)))))(((((((.(((.............(((.............(((((....(((((((...............)))))))...))))).............)))..))).))))))).....(((..((((((((.((....)).))))))))..)))..(((((((((((((..(((....)))((((.....(((((((((((((((......)))).)))))))))))......))))((((((((((.((............)))))....)))))))..((.((((((.((((.((((....)))).)))))))))).))..(((((((((((((((..(((((((((....(((((.((((((..((((..(((((...((((((((......))))).(((((....))))).((((((.....))))))..)))...))))))))))))))).)))))))))))))).....)))).)))..))))))))............(((.((((...)))).))).))))).)))))))).(((((((((......((((((........))))))............(((...(((((.(((((((.....(((((.(((((((...))).)))).))))).....))...))))).))))))))...........(((((((((...((((...(((((..((..((((((((((((...((((...................))))...))))))))))))..))..)))))....)))))))).)))))......((((....))))(((((...........)))))......)))))))))..))))))))))))))).....)))))))))((.(((.(.((((((((((((((((((.(((((((..(((((((.((.(((((((((....((((((...............((((((((.(((.......((((..((((((((..((..((((((((..((((((..........(((((........)))))........))))))))))))))....((((((.....)))))))).))))))))...)))).....))).)))))))))))))).)))))).)))))))))))).))))))).)))))).......(((((((.(((.......))).)))))))(((((............))))))))))))))))).)))).))((((....))))....))).))))))))..)))).))))))))))))(((((..((((((((((......)))))...))))))))))........(((((((((...........)))).))))))))))...))))))).)))))))))))))))))))..))))...((((((((((............))))))))))......))))))))).))))...((.((((((((.((........))...).))))))).))..(((((((((..((((.((.((((.(((((((.((..(.((((((((((((((((((...........((((((((....(((((((...)))))))..(((.(((.....)))))).............((((....((((((.........))))))..))))...)))))))).......)))))...))))))............((((((((...(((.((((....(((((((......)))))))....))))..)))....)))))))).))))))).)..))))))))).))))....))))))...))))))))).....((((.((((((((.......))))))))))))))))))))))))(((((((((................)))))))))..)))))))))).))))))..)))))............((((.(((((.((......)).)))))))))...((((.((((((((((((((((..(((..((((((((....))))))))))).))))).)).))).)))))).)))).....((((...(((((....)))))...)))).........(((((...))))).((((((((((...(((...((((((.((((.((.................(((((((.((.(..(........)..))).))))))).....(((((((..............................(((((((((((...((((((.....)))))))))))))))))(((((((.(((.........))).)))))))..((((.(((.....((((((((((((((((.((.....)).))))).))...)))))))))...))).))))...................))))))).(((((((...)).)))))..)).)))))))))).((((((...(((((((....)))))))))))))...............)))..))))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((((((((((((((((..((((.((((((.......)))))).)}..))..))))))).))))(({((({{{(.{.{(((........))))}})))}..,,,.)))},},({((,((((({({(,.{|,|.{((((((((...(((..(((((((((...((({{(((..((.((.((((....))))...}}}),)))))))......)))).))))).))))))))))).).).)}}}})),}))))).))))...((({,((((((,{{(({{(...(((({......,.....,.))))}.,))}))).,.,)))))))))}....)))}}}}....,{{{((({,{{...,(((,(({(((,.,{{,,(((({(((({{{{.,,,,,((((((((.....)))).)))).,{({,,,.{(((((({(((((((((((((((((..((((((((((.((..((((((...{{{,.........}}}}))))))..)).))))).)))))..))))))),.((((((.(.((((....(((((.((((.((,({((((.,,..,{{....,,|,,,.((((.((((....)))).))))}}}},{((((((((............((((((....)))))|,,,(((((((.((((.((..............))))))...))))))).,||||.........(((((.((((((((({{(.,(((((,{.....})))))}))......))))))))))))))}}}}}(((({....}))))...))))))))}(((((((({,,....},)))))))}.(((.(((.(((..((......)).))).))).)))||{{,{||||||||{{,,,.||,,......},))))).}})},{(((.......))))}.,,.)))))).)).)))).))))),,)))).).)))))).....})))))))|({,.......}|,...(({{{{{,{,,{{|{{{,,,,({{{{,,{{(,{{{(,..((({...,{,((((((,({((((((.{((((((((({((((((((({.{{(({(({...((((((.(((..(((((....))))).)))))))))...,{{||,||.|{{{|.|||,|,,,..,,,,,,.....},))),)}}}|.....||}||.(((((((((,...}))))))))),.,,(((({{,,}|},{{{.,..))),,...((((({....}))))){||||||.(((,(({({(,{{(,,,,|||{{|,}|||,.}}}.))))|||{...||},((((,{((((((((..................((((((((((,,.((((.....)))).,....)))))))))).(((((((((((((((((((..((((((..(((.((.(..((((..(((((((.((.........)))))))))))))..)))))).(((((((.....)))))))................((..(((((((((.......)))))))))..)).)))).))..))))))))))}((((..((((((((...(((((..((({{......{{{{{(((.(((((.(((((((.........(((((....(((((((((..((((((.,,...{((.,....((((((((((..,,,(((({.,....||||||,|{,,{(((,.{{{{{,,,,,.....{((,..((((.((((((((((....({{.,(.((((((((((..(((..(((((...((.{..............}))...)))))..)))..))))))..}))).,,.}))...)))).)))))).))))..)))...,,.(((({......,,.,}},}}}}}.))}}}}.,}}}}.,{{....{|||.{(((((({..(({...})))))))))}.}})),,,}}})))))))))).,....))},,..)))))).)))))))))..)))))))))))).))))).))).})))).....,},,)))))...........))))))))..))))........)).))))))..))))))))))))).........{{(({{{{{{{{.,,,||||||,,|,.||,,....((((({.....,.{({.(((((((,,,..({{,{,........,.,(((,,,,,..|}|,,{{{,{.||||||,,.|}}}}}}.}|}|.,...}}}}}}((((((.(((....))).))..))))..||,|})}})}.||)))}})))))})....,))}}}}},....||}|||....}}}}}})}))},..........{{(((({.,,,....}}}}}}).........,,,,,,,.,||||}|....),,)))))}}|.(((((((((.........)))))))))...........,,,,.,}}}}}||}}||.}}}}}},,,,..,,,,,|,,..||||,.,.|}||))|,.,},..}|||,,}}}|{|||,{|||||,{{|||{,|{{{,,,.,...,...,.,|||}|||,{((((((....,,}}}}}}}..,,,..,}||||.,,{....,{||||,,,{{{||||{{{||||,{((((,{{{|,|,,}|||||||......}}}}.,}|||}},}}})},,.,.}}}},})))))}})}.,,,...,{||||||,|{{{{{{{{{{{{,{{|{|||{{|,{,.,,,.,,.,,}}}|,|||||||,,,|||,|{{{..((((((,...,))))))..))}|||},,{{{,,,,|,||||||||,{{{{(((({{{(((((({{{(((({,,,,..(((({,,,{{||||||,.....,,,,))}}....))))))}})))}}})),,|{|,,.((((((.(((({....})))).)))))},,,,,,,}}}}}}||,...((((((.,{(((({...})))},},.))))))...{(((.(((((((({.......|{{((,,,.....)))}|{|{..,(((((((.(((((((....((((((((....{{{{{{....,,,.....||||}}..(((((.(((((((...,{,.....,|,.,,,{{|,.{(({{{{{,.,{({{,,|||}|}}},,{..(((.{{{{.....)))}.))),|},..}})))),))}{(((....))))))))))).))))).,,....,|..(((((((((((((((((((((((((....((((.((((((,{{(....}}),..)))))).))))...........,,.............,,,),.....})))))))))))))......,({((({,,..,}}}}}....,(({({{{{{||,..,}}})))),})}}........|{{{{{.....,..,,,,|||}},..|||,|||{||{{((,,,,,.((((({,,,.,...,}..((((.{((((..(((((((,,,,.,........)),...)))))))....))))}.))))|||||....,}},,}}}))......|,|{|(((((.((({{{((((({{.{,.(((((((...........})))))}.|,,}}}})}..,,,.{{{{{{,{{(((,{{{{..{(((((((((...}))))))))},|||||{{{,,,{{{(,..,{{{{{{{{|||{{{{,{,,,,((((((.......))))))((((((,...,)))))).........,,,,|||||},|}}|)}},,.,,,,...,|||||||..,...}}}}},,,.,,..{(((((....)))))}{{{{({{{..||.,.....,,.}),)))))}}}.,.,))))))),.....,.......{{{(({....)},}))}....,,}))}))...........||||||((((.((((...)))).))))|((((((((((....))))))))))}....{(((((......)))))))))).)))))))}...,.....((((({....}))))).{(((((((((((((.((((........)))).)))))))))))))}},},}}}}})).))}|||{,,,.||}}}||,,....,,,{{,,,,,{{{,,,|||.,,,,.....)}}))}))},...,.((((((((.(((,,.......)))..))))))))...)))))))))))..,..((((((((((((((((((.(((,((((((((.....(((.((((((((((((..,{(({...|}}}|(((((((.(((.,,...,,({,,.,{|,,.........,.{{,{{.||,{({{{{{.........,,..,,|}}}}}}...,,}}}...........,.}}).}))).)))))))}.,|{{{{{.{(((((((.((....)).))))))))..,,,..(((((((((((((.,(((....))){{{{|,||,(((((((((((((((......))))))))))))))))....,.}}|}{((((((((({{(............}))))},.,,))))))..{{.((((((.((((.((((....)))).)))))))))).))..(((((((((((((((..(((((((((....(((((.((((({.,{{{,,.(({({{{{({{{{{{{,,,,.,))))}}{({{{....})))).((((((.....))))))..,}},,.}}}})}}}})))))).)))))))))))))).....))))},))..))))))))............(((.{(({...)))).))).))))),)})))))).(((((((((......{(((((,...,,.,}}}}},............(((...(((((.(((((((.....(((((.(((((((...))),}))).))))).....,,...))))).))))))))......,....(((((((((...((((...(((((..((..((((((((((((...{{{{.....,.,...........}})}...))))))))))))..))..)))))....))))))))},))))....,,((((....))))(((((...........)))))......)))))))))..))))))))))))))).....))))))))|((.({(((.(((((((((((,.{{{{,..(((((({.,,,,{{{{,,,{,,,,||,...,{((.((((((({{{,{{{..{{((((((.((.(((({,{.{((({..{(((((((..(({{((((((({..{(((((,,.,,.....((({{.,{...,,}|}}}...,,...})))))))))))))....|{{{{{,,,..,)))))}}.}}}}}})),,,|,.....,))))}}}},)))))..)).)))))),}),,)))))))))))))))))})))))}.,,{|||,{{{{{{,|||}...,,.}}}.,))}}}{(((((............))))))))))))))))).)))).))|(((....)))}....))).))))))))..))))))}))))......{(((,.,((((((((((......)))))...)))))))))),,,,....(((((((((.......,...)))).))))))))))...))))))).}}}}}}||||||{{{{||},..},))))))}.,{{,,,.,.,}},..{{......))..},,,.,.))))))))).))))...{|.|{||||{{.{{.......,)),,,},}}))))),}},.((((((({(..{{((.,{.{{{|.|{{{||||{{..{.{{{{{{{|{{{{||{|||...,......,|{({,,(({{{.(((((({...|)))))}.,|||,((({....,,})))}...,,},,,,,.,|||,,,,||||{{.........}))))),,))))}||}||,,},)}}})}..)}))),..)})))),,..........((((((((...(((.((((....(((((((......)))))))....))))..)))....)))))))).})))))),)..})))})))).,}}},,..,,))))...)))))))))....(((((.((((((((.......)))))))))))))...||||||}|{{,|.|||||||,,,.,..,|,{{{{|{{|,||}}||})}},||,{.,.{|||||}}||{{,|||||,,,|,||||,{{{{{,{{......}}.})))})}}}...|{{{.({(((((((.,,|{{{,.{{,..{((((({{....)))))))}|||,|}))}..}.})),,))))),)))}.....{|||,..|||||,,,,)}}})}}}))))..,,.,,}}))))))}.}}))}.||||||{||,,..|,,..,||}|}|.||||}||}}}}}}}..,,,.,,,,{{{((((,(({(,,,.,{{{,..,,,{||.|||,,,...)}}.||||||}}}},.}}}}.}.}}}}),,,.........(((((((((((...((((((.....))))))))))))))))){{{((({.|||.,.......,}),)))))}}..{(((.((,,{...{{{(((((({((((((.({.....)).)))))}.)...)))))))))..)),).)))}.,,,,,,,},.........},,}}},,|||||}},.)))},..,)}}|)}))})))}})}|((((,,.}}}||||||.,..||||||||||||}..........,.,..}}))}),,,,,,)))))},..
Summary

Predicted to be involved in lipid homeostasis. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in endoplasmic reticulum. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.