Basic Information

Symbol
TMEM59L
RNA class
mRNA
Alias
Transmembrane Protein 59 Like BSMAP C19orf4 Brain-Specific Membrane-Anchored Protein Transmembrane Protein 59-Like Chromosome 19 Open Reading Frame 4
Location (GRCh38)
19:18607430-18621040
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012109.3
Sequence length
1621.0 nt
GC content
0.6440

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-703.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -731.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 680.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((..((((....))))..).)))))).((((((.....((((((.(((.((......))((.(((((((((((((((..(((..(((((((((((((......))))))))..((((((((.(((((((.((.((((....)))).)).))....(((((.(((((((((((.....)))).((((.....))))...(((....((((..(((((((.((((.(........).)))))))))))....))))))))))).))).)))))(((...(((.......))).))).(.(((..((.((.((((.((.(((.((((((((((((......(((....)))..(((((.....(((...))).....))))).......))).)))..))))))))).)).))))))))..))).).))))))))))))).((.(((((....))))).)))))))))).)))))))..(((..(((..((((((((((((...(((((((((((((.((((.....)))).))))))...).))))))...(((((((......((((....(((....((((......))))....)))))))......))))))).(((((.(((((...(((.(((..((((((...(((((((((((((((((....))))...((((((((.(((((((...(((((((........((.((((((.....(((((((((.(((((((((.((((..((...((((.(((.(......).)))..)))).)).)))).)).....((((..((...((((.((((((((..(...((((((((((((.(((((.....)))))..))))(((((((..((((((((...)).)))))).(((.....)))...........))))))).....))))))))...).)))))))).))))....))..))))...)))))))..(((((((.........)))))))......)))))))))....))))))))...(((..........)))((.(((((((....))).)))).)).......((((((.(((.....(((......)))))))))))))))))))((((.........)))).))))))).))))))))((((.......)))).(..(((((((.(((..((((((((((((.(.......(((......................)))........).)))))))..)))))...))).)))))))..)((((.((((((((.((((.(((((.((((((((...))))))))))))).)))).)))......)))))))))............))))))))).)))).)))))).......)))))).))))))))))....))))))).)))))...))).)))...)))))))).))))).))))))((((((((((((.....))...))).)))))))....((((((((.((((((((((.......))))).))))).))).))))).....(((.(((((....((((.(.....).))))....)))))))))))))).....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.((((((..((((....}))).,||||}}||.(((((({,{{,((((((,(((|((,{..,.,|((,({{(({|{{{{{{((,{(((,.{((({(((((((((.{({{|(({|,((.((.((,,,.}|,||,||.||,||||}}}.)))),))}||,,||((({(,{{{(({{((((.....)))),((({.....))))...{((....({((..(((((((.((((.(........).))))))))))).,,,|||||||||||,|||,|}}})|||,.,|||,,....,||((((|...})))).}}|{.(({|,||,|((.(((((({(((((......,{(,,,,},,..(((((.,...(((...})).....))))}.......)}).)))..))))))})).)),}}}}}},,,.,.,))})))}})}|})|}|||,.|||||,.,,))))).)}}}})))}},)))})))|,|{||}||,||{(((((((((((,,.{((((((((((((.(((|.....}))).)))))),,,}}}}}}},...((((({{{{{{..,|||,...,,{.,,{(({,.....,,}}}...}))))|||......}}))})}.((({,.{((({...{{(.(((.,{((({({{{{((((({{(((({({{(({{({{{{{,((({{{(({,(({{({{{{{||||,||}|.,}}}|||}||||||}|}|,|||||||{{|||(((,{,,.,|{|}},,{,,(((({(({{{{{,,{{,,|||{,||||{||.||,|{|,.,{{{,,.(((((,,((((({((((((.{({({,{.(((...(((({.{({({.....))))},,))))).))).))))))))))))}....,,....))))))))))),)))},}})}},|{|||||,,|,||{|||||||,(,((({||,.{..((({...,)))},})..}))),}}}..|||||||},,,,....,))))))}}},,..((((((({...}))))))),.,,|||}.,.,,.,.,}},((.(((((((....))).)))).)).......,,|,,..(((.{{((((({{{{.,||,}|||||||||{{{{...((((((....((((.....)))))))))).{{{((({,,,,...}}}}|}}}{||{|||,{||.,||||||||||||}}}}},,}},||}..................,..|||{,.,{{{{{{||||},,,.|||||{{.|||.|}}))))|,|{{{|||{{{{{||}||||,|||||.|||||{{||.,||||}}}}}}}}}|||||,|.......))))))}}||,,{.....,,..,},},}}}),))),.,,,))).....}})))))),)))))})))},,.,)))))))}}}}}}.,|||||||||,.}}))))))})))},}}))))|{((((((({{|||,,..}).,,)))}}))))}},...{{((((({.((((((((((.......))))).))))).))),)}))),,...{((,(({{{....,{||,|,...})}))}},..,)))))))))))))).....................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_012109.3 NCBI
GUCAGCGCCCCGGUCCCCGCCGCAGCCGCUGCAUCCUCCGUGCCCGGCC… 1621 nt 0.6440
Summary

This gene encodes a predicted type-I membrane glycoprotein. The encoded protein may play a role in functioning of the central nervous system. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.