Basic Information

Symbol
TMOD2
RNA class
mRNA
Alias
Tropomodulin 2 NTMOD Neuronal Tropomodulin Tropomodulin-2 Tropomodulin 2 (Neuronal) N-TMOD N-Tmod
Location (GRCh38)
15:51751564-51816363
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014548.4
Sequence length
9150.0 nt
GC content
0.3993

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2531.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2713.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2065.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142885.2 NCBI
GUUGAUCGCCGCGCUCGCCCCGGCCACGGCGCCGCCCCUGUUCUCCCGG… 9042 nt 0.3979
NM_014548.4 NCBI
GUUGAUCGCCGCGCUCGCCCCGGCCACGGCGCCGCCCCUGUUCUCCCGG… 9150 nt 0.3993
Summary

This gene encodes a neuronal-specific member of the tropomodulin family of actin-regulatory proteins. The encoded protein caps the pointed end of actin filaments preventing both elongation and depolymerization. The capping activity of this protein is dependent on its association with tropomyosin. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Dec 2008]

Forensic Context

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