Basic Information

Symbol
BHMT
RNA class
mRNA
Alias
Betaine--Homocysteine S-Methyltransferase BHMT1 Betaine--Homocysteine S-Methyltransferase 1 Phi-Crystallin EC 2.1.1.5 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Li 61p Betaine Homocysteine Methyltransferase HEL-S-61p EC 2.1.1
Location (GRCh38)
5:79111807-79132289
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001713.3
Sequence length
2470.0 nt
GC content
0.4478

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-740.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -789.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 540.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001713.3 NCBI
AGCUCGGGGCUGCGCAGCGGGAAGGCUCGCCUAGUCGGUCCGCAUCCGU… 2470 nt 0.4478
Summary

This gene encodes a cytosolic enzyme that catalyzes the conversion of betaine and homocysteine to dimethylglycine and methionine, respectively. Defects in this gene could lead to hyperhomocyst(e)inemia, but such a defect has not yet been observed. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the BHMT was one of the most expressed genes in liver tissue [Scrivano et al. DOI:10.1007/s00414-019-02125-x], and another investigation in mouse liver showed its expression was commonly up-regulated following in vivo exposure to α-particles from boron neutron capture, as validated by real-time PCR [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078]. Another systematic review confirmed its investigation as a liver-specific marker for post-mortem interval estimation in mouse models [Cianci et al. DOI:10.3390/ijms25158185].